近日,中國農(nóng)業(yè)科學院牧醫(yī)所奶產(chǎn)品質(zhì)量與風險評估創(chuàng)新團隊在瘤胃尿素分解菌分離培養(yǎng)方面取得新進展,新分離一株霍氏腸桿菌Z129并揭示泛基因組特征。相關研究成果發(fā)表在《微生物學前沿(Frontiers in Microbiology)》上。
尿素是反芻動物重要的非蛋白質(zhì)氮源,尿素的利用依賴于瘤胃尿素分解菌的活性。隨著測序技術(shù)的發(fā)展,越來越多的尿素分解菌通過非培養(yǎng)技術(shù)被發(fā)現(xiàn),但瘤胃中超過55%的尿素分解菌未被分離培養(yǎng)。
本研究通過調(diào)整培養(yǎng)基成分分離培養(yǎng)出一株尿素分解菌,利用全基因測序?qū)ζ浠蚪M和功能基因進行分析,發(fā)現(xiàn)該菌株屬于霍氏腸桿菌,命名為霍氏腸桿菌Z129?;蜃⑨尠l(fā)現(xiàn)發(fā)現(xiàn)尿素轉(zhuǎn)運基因( urt A- urt E)、鎳離子轉(zhuǎn)運基因( ure J、 ton B、 nix A、 exb B、 exb D和 rcn A)、尿素水解基因( ure A- ure G和 ure J)、氨同化基因( gdh A、 gln A、 gln B、 gln E、 gln L、 gls A、 glt B和 glt D)等尿素代謝相關功能基因。泛基因組分析發(fā)現(xiàn),Z129攜帶 app A、 nrf A、 wec E等與飼料轉(zhuǎn)化率、氮歧化還原和乳糖合成相關的特異基因。Z129分泌多種碳水化合物酶,有利用碳水化合物水解的能力,同時具有較高的尿素分解能力。因此,瘤胃中霍氏腸桿菌Z129的分離將有助于作為尿素分解模式菌株,用于研究尿素代謝機制。
仲慧月為文章第一作者,王加啟、趙圣國為通訊作者。該研究得到國家自然科學基金項目、中國農(nóng)業(yè)科學院科技創(chuàng)新工程和動物營養(yǎng)學國家重點實驗室項目資助。
原文鏈接:https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1169973