近日,農(nóng)業(yè)微生物學全國重點實驗室、湖北洪山實驗室、華中農(nóng)業(yè)大學動物育種與健康養(yǎng)殖前沿科學中心晏向華教授團隊研究成果以“Lysine crotonylation regulates leucine-deprivation-induced autophagy by a 14-3-3ε-PPM1B axis”為題在Cell Reports發(fā)表,研究揭示了亮氨酸通過賴氨酸巴豆?;揎椡緩?a href='http://m.unionsn.com/tag_4557.html' class='zdbq' title='調(diào)節(jié)相關食品資訊' target='_blank'>調(diào)節(jié)自噬起始過程的分子機制。
生豬精準飼養(yǎng)的重要前提之一是盡可能多地解析營養(yǎng)物質(zhì)在體內(nèi)的消化、吸收和代謝過程中的生化代謝途徑及其營養(yǎng)生理功能。亮氨酸作為豬必需氨基酸之一,主要功能之一是作為底物參與蛋白質(zhì)合成,近年還發(fā)現(xiàn)其可作為信號分子參與營養(yǎng)物質(zhì)代謝過程。當機體處于亮氨酸饑餓等營養(yǎng)物質(zhì)缺乏的應激狀態(tài)時,自噬過程會被激活,自噬體包裹待降解的底物與溶酶體融合,內(nèi)容物在溶酶體水解酶的作用下被降解,降解產(chǎn)生的小分子營養(yǎng)物質(zhì)會重新被機體吸收利用,以滿足應激條件下的營養(yǎng)需要,維持機體穩(wěn)態(tài)。亮氨酸饑餓誘導的自噬過程受到多種蛋白質(zhì)翻譯后修飾的嚴格調(diào)控,然而是否有新型翻譯后修飾形式參與其中尚不清楚。
研究人員首先鑒定到亮氨酸饑餓過程中賴氨酸巴豆?;揎楋@著上調(diào),當飼喂亮氨酸饑餓日糧一周后動物肝臟巴豆?;揎椝揭囡@著增加。巴豆?;揎椉せ顒㎞aCr處理提高巴豆酰化修飾的同時,會激活細胞自噬過程的發(fā)生。因此,這一結(jié)果提示巴豆?;揎椩隗w外或體內(nèi)都與自噬水平呈現(xiàn)正相關的關系。
接下來,研究人員通過賴氨酸巴豆?;揎椀鞍踪|(zhì)組學鑒定到了一系列受亮氨酸調(diào)控的巴豆?;揎椀鞍住Mㄟ^生物信息學數(shù)據(jù)及驗證試驗,進一步發(fā)現(xiàn)14-3-3ε 蛋白的K73和K78巴豆酰化修飾可能在亮氨酸饑餓誘導自噬過程中發(fā)揮重要作用。14-3-3ε蛋白巴豆?;笔蛔僈73R和K78R可顯著抑制細胞自噬過程的發(fā)生。通過14-3-3ε蛋白巴豆?;揎椃肿觿恿W模擬試驗,K73和K78巴豆?;揎椏娠@著增加蛋白質(zhì)分子構(gòu)象不穩(wěn)定性,使蛋白質(zhì)分子二級結(jié)構(gòu)處于一種無序的狀態(tài)。
最后,研究人員鑒定到PPM1B蛋白是14-3-3ε蛋白下游效應分子,該蛋白與14-3-3ε蛋白的互作會在亮氨酸饑餓處理后消失,PPM1B與14-3-3ε的互作又受到HDAC7調(diào)節(jié)的巴豆?;揎椀恼{(diào)控,而PPM1B是自噬起始因子ULK1的磷酸酶。綜上,該研究揭示了亮氨酸缺失首先抑制HDAC7活性,上調(diào)14-3-3ε蛋白的巴豆酰化修飾水平,促使PPM1B蛋白與其發(fā)生解離,釋放的PPM1B去磷酸化ULK1,進而激活自噬起始過程的發(fā)生的分子機制,為生豬精準飼料配方設計提供理論基礎。
農(nóng)業(yè)微生物學全國重點實驗室、湖北洪山實驗室、動物育種與健康養(yǎng)殖前沿科學中心博士研究生鄭子龍為第一作者,上海交通大學醫(yī)學院鐘清教授和華中農(nóng)業(yè)大學動物科技學院動物醫(yī)學院晏向華教授為共同通訊作者。該研究受到了國家自然科學基金、國家重點基礎研究項目(“973”計劃)的資助。
【英文摘要】
Lysine crotonylation as a protein post-translational modification regulates diverse cellular processes and functions. However, the role of crotonylation in nutrient signaling pathways remains unclear. Here, we find a positive correlation between global crotonylation levels and leucine-deprivation-induced autophagy. Crotonylome profiling identifies many crotonylated proteins regulated by leucine deprivation. Bioinformatics analysis dominates 14-3-3 proteins in leucine-mediated crotonylome. expression of 14-3-3ε crotonylation-deficient mutant significantly inhibits leucine-deprivation-induced autophagy. Molecular dynamics analysis shows that crotonylation increases molecular instability and disrupts the 14-3-3ε amphipathic pocket through which 14-3-3ε interacts with binding partners. Leucine-deprivation-induced 14-3-3ε crotonylation leads to the release of protein phosphatase 1B (PPM1B) from 14-3-3ε interaction. Active PPM1B dephosphorylates ULK1 and subsequently initiates autophagy. We further find that 14-3-3ε crotonylation is regulated by HDAC7. Taken together, our findings demonstrate that the 14-3-3ε-PPM1B axis regulated by crotonylation may play a vital role in leucine-deprivation-induced autophagy.
論文鏈接:https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(22)01742-9