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中國熱科院發(fā)布西番蓮染色體級別精細(xì)基因組

放大字體  縮小字體 時(shí)間:2021-01-29 10:24 來源:中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院 原文:
核心提示:近日,中國熱科院??趯?shí)驗(yàn)站西番蓮育種高效栽培研究團(tuán)隊(duì)在西番蓮染色體級別基因組解析和風(fēng)味物質(zhì)合成機(jī)理研究方面取得重要進(jìn)展。
  近日,中國熱科院???a href='http://m.unionsn.com/tag_4793.html' class='zdbq' title='實(shí)驗(yàn)相關(guān)食品資訊' target='_blank'>實(shí)驗(yàn)站西番蓮育種高效栽培研究團(tuán)隊(duì)在西番蓮染色體級別基因組解析和風(fēng)味物質(zhì)合成機(jī)理研究方面取得重要進(jìn)展。

  研究團(tuán)隊(duì)利用Illumina、Nanopore、Hi-C測序,采用NextDenovo + SMARTdenovo + NextPolish策略組裝,獲得~1341.7 Mb的基因組,經(jīng)與其它19種近緣植物基因家族比較分析,發(fā)現(xiàn)西番蓮與大戟科(蓖麻,橡膠樹和木薯)親緣關(guān)系最密切,發(fā)布西番蓮染色體級別基因組,明確百香果的進(jìn)化地位;此外,從基因組、轉(zhuǎn)錄組和代謝組等多組學(xué)角度挖掘了影響西番蓮風(fēng)味的潛在基因和基因家族,明確α-亞麻酸代謝、代謝途徑和次生代謝途徑是參與西番蓮風(fēng)味形成過程中重要揮發(fā)性有機(jī)物(VOCs)合成的主要途徑,為西番蓮的改良栽培提供寶貴的資源。

  該項(xiàng)工作相關(guān)研究結(jié)果,以題為:“Chromosome-scale genome assembly provides insights into the evolution and flavor synthesis of passion fruit (Passiflora edulis Sims) ”在中科院JCR一區(qū)的TOP期刊《Horticulture Research》發(fā)表。中國熱科院??趯?shí)驗(yàn)站黃東梅助理研究員、海南大學(xué)夏志強(qiáng)副教授、齊魯工業(yè)大學(xué)張圣奎博士為共同第一作者,中國熱科院??趯?shí)驗(yàn)站宋順副研究員、詹儒林研究員為通訊作者。該項(xiàng)工作得到了中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院專項(xiàng)資金支持。

  文章鏈接:https://www.nature.com/articles/s41438-020-00455-1


  西番蓮花果形態(tài)和基因組圖譜
  西番蓮基因組的進(jìn)化分析結(jié)果
  西番蓮脂肪酸代謝及萜類生物合成途徑的表達(dá)熱圖及代謝產(chǎn)物含量
日期:2021-01-29
 
 地區(qū): 海口市 海南 中國
 行業(yè): 轉(zhuǎn)基因食品 食品檢測
 標(biāo)簽: 實(shí)驗(yàn) 基因
 科普: 實(shí)驗(yàn) 基因
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