近日，華中農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院益生菌智造創(chuàng)新團(tuán)隊趙述淼副教授課題組在國際學(xué)術(shù)期刊Microbiome上發(fā)表題為“metagenome-assembled genome reveals species and functional composition of Jianghan chicken gut microbiota and isolation of Pediococcus acidilactic with probiotic properties”的研究論文，研究采用宏基因組測序技術(shù)揭示江漢雞腸道微生物群物種和功能組成以及分離了具有益生菌特性的乳酸片球菌。

 

　　雞是全世界養(yǎng)殖最廣泛的動物之一，在肉類和蛋類生產(chǎn)中發(fā)揮著重要的作用，其腸道微生物群對于雞的健康、疾病、生長和產(chǎn)蛋性能至關(guān)重要。中國本土雞種腸道微生物多樣性豐富，潛在的腸道微生物資源可能為宿主帶來健康益處。江漢雞作為我國江漢地區(qū)獨(dú)特的品種，已有300年的歷史。它的適應(yīng)能力強(qiáng)，耐粗飼，肉質(zhì)細(xì)嫩，對飼養(yǎng)要求低，生長速度相對較慢，由于其應(yīng)激反應(yīng)強(qiáng)烈，不適合集約化養(yǎng)殖，主要養(yǎng)殖方式為平地散養(yǎng)。

 

　　研究團(tuán)隊利用宏基因組測序技術(shù)分析了長江流域附近四個城市江漢雞腸道微生物的物種和功能組成。結(jié)果表明，江漢雞腸道菌群的細(xì)菌種類組成與其他雞品種相似，其中Phocaeicola和Bacteroides是最豐富的細(xì)菌屬。LEfSe 分析顯示荊州樣品與其他三組樣品之間的物種組成和功能特征存在顯著差異。功能注釋表明，江漢雞腸道菌群以代謝基因為主，其中與碳水化合物代謝相關(guān)的基因數(shù)量最多。發(fā)現(xiàn)了多個抗生素抗性基因（ARG），并且ARG的組成與集約化籠養(yǎng)雞相似，表明抗生素廣泛存在于江漢雞的腸道微生物群中。結(jié)合宏基因組的研究結(jié)果，從雞腸道中分離、鑒定出了829株微生物，并進(jìn)行了大規(guī)模的益生性評價，其中3 株乳酸片球菌（P. acidilatic）表現(xiàn)出較強(qiáng)的益生潛力。這些發(fā)現(xiàn)提供了對江漢雞獨(dú)特腸道微生物群的深入了解，并強(qiáng)調(diào)了益生菌株在養(yǎng)殖業(yè)的潛在應(yīng)用前景。

 

　　華中農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院碩士研究生沈紅葉、王婷慧為論文共同第一作者，趙述淼副教授為通訊作者。生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院彭楠教授、已出站博士后董衛(wèi)衛(wèi)也參與了本研究部分工作。該研究得到湖北省重點(diǎn)研發(fā)計劃（2020BBA054）和湖北省洪山實(shí)驗室重點(diǎn)基金（2021HSZD022）的資助。

 

　　原文鏈接：https://doi.org/10.1186/s40168-023-01745-1