近日,中國農(nóng)業(yè)科學院作物科學研究所作物精準育種技術(shù)創(chuàng)新團隊,率先研發(fā)出系列新型植物單堿基編輯器pAKBEs。7月31日,相關(guān)成果在《植物通訊(Plant Communications)》在線發(fā)表。
堿基編輯器可以在不形成雙鏈DNA斷裂缺口和無外源供體修復模板參與的情況下實現(xiàn)單堿基替換。目前已報道的胞嘧啶堿基編輯器、腺嘌呤堿基編輯器和C-G堿基顛換編輯器可分別實現(xiàn)胞嘧啶到胸腺嘧啶,腺嘌呤到鳥嘌呤和胞嘧啶到鳥嘌呤的單堿基編輯。研發(fā)植物新型堿基編輯器AKBE可利用一個向?qū)NA同時將靶序列編輯窗口內(nèi)的腺嘌呤(A)轉(zhuǎn)換為鳥嘌呤(G)或胸腺嘧啶(T), 將極大地拓展堿基編輯在農(nóng)作物基因功能研究和精準育種中的應用范圍,為生物育種提供有力工具。
研發(fā)團隊首先將腺嘌呤堿基編輯器ABE8e與人源烷基腺嘌呤DNA糖基化酶(hMPG)、hMPG突變體、反式激活因子VP64等融合,分別建立了第一代、第二代、第三代和第四代pAKBE系統(tǒng)。水稻原生質(zhì)體測試結(jié)果表明第四代pAKBE展現(xiàn)出較高的腺嘌呤到鳥嘌呤、胸腺嘧啶或胞嘧啶的堿基替換效率;水稻穩(wěn)定轉(zhuǎn)化結(jié)果進一步表明,VP64的使用顯著提高了pAKBE介導的腺嘌呤到鳥嘌呤或胸腺嘧啶的編輯效率,其中腺嘌呤到胸腺嘧啶的最高編輯效率為17.24%,腺嘌呤到鳥嘌呤的最高編輯效率為82.22%。pAKBE的開發(fā)極大地豐富了植物單堿基編輯工具箱,為水稻和其它農(nóng)作物重要基因功能分析和遺傳改良提供了重要技術(shù)支撐。
作科所博士研究生李玉才和副研究員李少雅為本文共同第一作者,夏蘭琴研究員為本文通訊作者。本研究得到國家自然科學基金基礎(chǔ)科學中心項目、海南崖洲灣種子實驗室揭榜掛帥項目、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部基因編輯創(chuàng)新利用重點實驗室(海南)和作物分子育種國家工程研究中心等資助。
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https://doi.org/10.1016/j.xplc.2023.100667