近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所豬遺傳育種科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在豬基因組選配研究方面取得了新進(jìn)展，提出了新的基因組選配方案，相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《動(dòng)物科學(xué)與生物技術(shù)（Journal of Animal Science and Biotechnology）》（IF=7.00）上。

 

　　據(jù)團(tuán)隊(duì)首席王立賢研究員介紹，目前在純系豬群開展基因組選擇，往往重在選，不在配?；蚪M選擇基于GEBV值選留優(yōu)秀個(gè)體，但是隨著世代數(shù)的增加，必然造成純合子增加和近交年增量積累，逐漸產(chǎn)生近交衰退現(xiàn)象。針對這個(gè)問題，可以利用基因組信息來預(yù)測后代群體的近交增量和遺傳進(jìn)展，從而確定最佳的交配組合，最終實(shí)現(xiàn)近交增量的有效控制和遺傳進(jìn)展的可持續(xù)。

 

　　本研究提出了通過具有相同IBD片段的長純合片段（ROH）信息計(jì)算純系豬群個(gè)體近交系數(shù)和個(gè)體間親緣關(guān)系，然后通過近交增量和遺傳增益作為平衡點(diǎn)選擇最佳的交配方案，并對基因組選配方法和傳統(tǒng)交配方法進(jìn)行了比較。研究表明，在獲得相同的預(yù)期遺傳增益下，基因組選配方法在控制近交增量方面明顯優(yōu)于其他方法。基于ROH構(gòu)建的親緣關(guān)系矩陣的選配方案比基于SNPs構(gòu)建的親緣關(guān)系矩陣具有更快的遺傳增益。無論遺傳力如何，GROH為基礎(chǔ)的最大遺傳增益基因選配方案的遺傳增益率ΔG比同質(zhì)交配高0.9%~2.6%，但近交增量率ΔF比同質(zhì)交配低13%~83.3%。同質(zhì)交配的近交率總是最快的。相關(guān)研究結(jié)果也在純種大白豬種群的總產(chǎn)仔數(shù)得到驗(yàn)證。

 

　　牧醫(yī)所趙福平研究員為該文章的第一作者，王立賢研究員為通訊作者。該研究得到了國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程重大科研項(xiàng)目和國家生豬產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系經(jīng)費(fèi)資助。

 

　　原文鏈接：https://jasbsci.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40104-023-00872-x