為提升牦牛種質(zhì)資源保護(hù)利用與科研育種水平,推動(dòng)青海省牦牛育種產(chǎn)業(yè)發(fā)展,青海省科技廳組織實(shí)施重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目“牦牛高密度芯片的制備及高效利用技術(shù)研究”,利用CAGT®液相探針雜交捕獲測(cè)序技術(shù)開發(fā)了一款適用于高原牦牛的靶向捕獲育種芯片——“青芯一號(hào)”(牦牛30K芯片),現(xiàn)取得階段性成果。
“青芯一號(hào)”由青海省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院和西南民族大學(xué)聯(lián)合北京康普森農(nóng)業(yè)科技有限公司共同開發(fā),是基于80個(gè)牦牛樣本重測(cè)序數(shù)據(jù)開發(fā)的高質(zhì)量SNP。經(jīng)過位點(diǎn)過濾、篩選和優(yōu)化,最終得到29223個(gè)SNP位點(diǎn),其中涵蓋了1145個(gè)功能位點(diǎn),具有針對(duì)性強(qiáng)、功能相關(guān)性廣、靈活性及性價(jià)比高等特點(diǎn)和優(yōu)勢(shì),芯片位點(diǎn)在測(cè)試樣本中的平均檢出率可達(dá)99.93%及以上。
“青芯一號(hào)”的推廣應(yīng)用為構(gòu)建牦牛全基因組育種技術(shù)體系提供了理論依據(jù),提高了青海牦牛育種效率和制種水平,為全省牦牛種質(zhì)資源創(chuàng)新和利用提供了一條科學(xué)、合理的選種、育種策略,有力助推青海省牦牛種業(yè)振興和發(fā)展。