北京市農(nóng)林科學(xué)院生物所在谷子miRNA研究方面取得新進(jìn)展

　　近日，北京市農(nóng)林科學(xué)院生物所在Frontiers in Plant Science期刊（影響因子5.753/Q1）發(fā)表了題為“The Construction forbid Exploration of a Comprehensive MicroRNA Centered Regulatory Network in Foxtail Millet （Setaria italica L.）”的文章。

 

　　在植物生長(zhǎng)發(fā)育和響應(yīng)環(huán)境應(yīng)答過(guò)程中，MicroRNA（miRNA）及其靶基因發(fā)揮重要作用。目前，通過(guò)遺傳學(xué)等方法對(duì)植物中單個(gè)miRNA的功能解析越來(lái)越多，但是谷子miRNA在基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的作用特點(diǎn)以及與轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控關(guān)系仍然未見(jiàn)報(bào)道。

 

　　該研究針對(duì)谷子拔節(jié)前期和灌漿前期這2個(gè)谷子生長(zhǎng)發(fā)育關(guān)鍵時(shí)期，開(kāi)展谷子miRNA深度測(cè)序、降解組和轉(zhuǎn)錄組等多組學(xué)聯(lián)合分析，構(gòu)建了以前饋環(huán)路（Feed-Forward Loop）為基準(zhǔn)單元的谷子miRNA為中心的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，其中包括36個(gè)轉(zhuǎn)錄因子家族、266個(gè)核心轉(zhuǎn)錄因子、136個(gè)miRNA和2417個(gè)下游靶基因以及他們之間的調(diào)控關(guān)系。

 

　　下一步，利用該研究篩選獲得的禾本科特有和谷子特有的核心miRNA，綜合前期谷子重測(cè)序相關(guān)數(shù)據(jù)、谷子種質(zhì)資源表型數(shù)據(jù)，挖掘和解析谷子千粒重等優(yōu)異品質(zhì)性狀的關(guān)鍵基因及其調(diào)控途徑。

 

　　我院生物所職工鄧楊和客座研究生張浩林為本文共同第一作者，我院張杰偉副研究員、魏建華研究員和楊效曾研究員為共同通訊作者，論文的第一通訊單位為北京市農(nóng)林科學(xué)院。該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、我院創(chuàng)新能力建設(shè)項(xiàng)目和國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開(kāi)放基金的資助。