中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黑龍江所“江鱈基因組資源開發(fā)與利用研究”取得重要進(jìn)展

　　江鱈（Lota lota）是鱈科（Gadidae）唯一的淡水種，廣泛分布在北緯45°以北的歐亞和北美的內(nèi)陸水域或海灣，在中國(guó)僅分布于黑龍江水系及鴨綠江上游和新疆的額爾齊斯河，是高寒水域珍稀的經(jīng)濟(jì)魚類。近期，在黑龍江省自然科學(xué)基金項(xiàng)目（LH 2019C089, LH2019C070）的資助下，黑龍江水產(chǎn)研究所在“江鱈基因組資源開發(fā)與利用研究”中取得重要進(jìn)展，相關(guān)研究成果“Chromosome-Level Genome Assembly of the Burbot （Lota lota） Using Nanopore and Hi-C Technologies”發(fā)表于中科院JCR 2區(qū)期刊《Frontiers in Genetics》（IF=4.599）（https://doi.org/10.3389/fgene.2021.747552） 。

 

　　該研究組裝了一個(gè)江鱈的高質(zhì)量的染色體水平基因組，基因組大小估計(jì)為565.64 Mb，雜合度為0.5%，錨定在24條染色體上。共注釋得到21,672個(gè)蛋白編碼基因，構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)果表明江鱈與大西洋鱈魚（Gadus morhua）的親緣關(guān)系最密切，分化時(shí)間約為4,921萬年前。

　　江鱈高質(zhì)量染色體水平的基因組的獲得，將為其生物學(xué)和進(jìn)化研究以及遺傳改良等提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)，對(duì)江鱈基因組資源開發(fā)利用，以及自然資源保護(hù)、恢復(fù)和有效管理具有重要意義。