隨著全球氣候變化,高溫脅迫對(duì)作物的產(chǎn)量和品質(zhì)的負(fù)面影響受到關(guān)注。高溫造成作物幼苗死亡、結(jié)實(shí)率降低、產(chǎn)量減少,也會(huì)影響作物的品質(zhì)。因此,挖掘水稻耐高溫基因,對(duì)于改良水稻品種耐熱性能以及未來(lái)作物的設(shè)計(jì)育種有重要意義。同時(shí),溫度也是影響水稻地理分布的一個(gè)重要因素。傳統(tǒng)的秈粳稻由于起源地和種植范圍的差異,對(duì)于溫度的適應(yīng)性有所差別,秈稻種植在溫度較高的地區(qū),一般對(duì)高溫有更強(qiáng)的抵抗能力,但是其中的遺傳基礎(chǔ)尚不清楚。tRNA硫醇化(mcm5s2U34)是一種重要的tRNA轉(zhuǎn)錄后修飾形式,在酵母、線(xiàn)蟲(chóng)、人類(lèi)中的研究表明,tRNA硫醇化對(duì)于維持生物體正常發(fā)育和代謝、響應(yīng)環(huán)境脅迫尤其是熱脅迫等方面發(fā)揮重要作用。然而,在植物中,tRNA硫醇化的功能以及它和高溫脅迫的關(guān)系仍需研究。
中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所植物基因組學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室姚善國(guó)研究組與儲(chǔ)成才研究組合作,發(fā)現(xiàn)tRNA硫醇化途徑中的關(guān)鍵基因SLG1在水稻抵抗高溫脅迫中起重要作用。SLG1編碼一個(gè)保守的細(xì)胞質(zhì)tRNA 2-硫化蛋白2(RCTU2),它的功能缺陷會(huì)導(dǎo)致水稻體內(nèi)的tRNA硫醇化水平缺陷,并伴隨明顯的高溫敏感表型;而過(guò)表達(dá)SLG1則可顯著提高水稻對(duì)高溫耐受性。分子遺傳學(xué)研究發(fā)現(xiàn),SLG1能夠與水稻中細(xì)胞質(zhì)tRNA 2-硫化蛋白1(RCTU1)互作,RCTU1功能缺陷也導(dǎo)致水稻tRNA硫醇化水平降低和高溫敏感表型。實(shí)驗(yàn)顯示,水稻的高溫耐受性和tRNA硫醇化水平呈正相關(guān)。通過(guò)對(duì)4219個(gè)栽培稻序列分析發(fā)現(xiàn),SLG1在品種中存在單倍型分化,其中96.1%的溫帶粳稻屬于一種單倍型,而93.9%的秈稻屬于另一種單倍型,暗示SLG1可能是一秈粳稻分化基因,核酸序列多態(tài)性分析也表明SLG1是一個(gè)顯著的馴化選擇位點(diǎn)。通過(guò)對(duì)近等基因系及轉(zhuǎn)基因植株的高溫處理試驗(yàn)表明,攜帶秈型SLG1的水稻植株比攜帶粳型SLG1水稻植株具有更強(qiáng)的高溫耐受能力,且與tRNA硫醇化水平呈正相關(guān)。通過(guò)啟動(dòng)子和編碼區(qū)互換不同轉(zhuǎn)基因材料熱處理實(shí)驗(yàn)顯示,SLG1啟動(dòng)子區(qū)和編碼區(qū)的序列差異共同決定秈型和粳型SLG1耐熱性差異。同時(shí),攜帶秈型SLG1的水稻植株對(duì)孕穗期高溫也有更強(qiáng)的抵抗能力。因此,該研究證明tRNA硫醇化修飾在水稻響應(yīng)高溫脅迫中的重要功能,并為應(yīng)對(duì)全球變暖、設(shè)計(jì)培育高溫脅迫耐受性水稻品種提供有效策略。
相關(guān)研究成果在線(xiàn)發(fā)表在Nature Communications(DOI: 10.1038/s41467-020-19320-9)上,姚善國(guó)研究組已畢業(yè)博士生徐玉芳和張麗為論文共同第一作者,美國(guó)愛(ài)荷華州立大學(xué)博士區(qū)樹(shù)俊參與研究工作,研究員姚善國(guó)和儲(chǔ)成才為論文共同通訊作者。研究工作得到中科院A類(lèi)戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專(zhuān)項(xiàng)、國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、植物基因組學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室支持項(xiàng)目的資助。
SLG1等位基因在水稻馴化中的選擇模式