近日,Science China Life Sciences雜志在線發(fā)表了中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所陳松林院士團(tuán)隊(duì)題為“Decoding fish genome starts new era of important traits study and molecular breeding in China”的綜述。該綜述總結(jié)了中國(guó)在魚類基因組研究和分子育種領(lǐng)域取得的重要進(jìn)展,并對(duì)未來(lái)的研究方向進(jìn)行了展望和探討。
水產(chǎn)養(yǎng)殖已成為全球農(nóng)業(yè)增長(zhǎng)最快的領(lǐng)域,水產(chǎn)食品對(duì)保障世界糧食安全和營(yíng)養(yǎng)做出了日益重要的貢獻(xiàn)。中國(guó)是世界第一水產(chǎn)養(yǎng)殖大國(guó),魚類是水產(chǎn)養(yǎng)殖的支柱產(chǎn)業(yè)之一,然而種質(zhì)退化、病害頻發(fā)、生長(zhǎng)緩慢等問(wèn)題嚴(yán)重制約了魚類養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。
2014年1月,陳松林院士領(lǐng)銜一個(gè)國(guó)際合作團(tuán)隊(duì)率先完成了重要海水養(yǎng)殖魚類——半滑舌鰨的全基因組測(cè)序和解析,論文在Nature Genetics發(fā)表,這不僅是我國(guó)發(fā)表的首個(gè)魚類基因組,也是世界上第一個(gè)比目魚類的基因組序列,實(shí)現(xiàn)了我國(guó)魚類基因組解析研究零的突破,標(biāo)志著中國(guó)魚類及育種技術(shù)研究進(jìn)入基因組時(shí)代。今年正值我國(guó)第一篇魚類基因組測(cè)序論文發(fā)表10周年,回顧總結(jié)10年來(lái)我國(guó)在魚類全基因組測(cè)序、重要性狀遺傳解析和分子育種技術(shù)建立與應(yīng)用方面取得的重要進(jìn)展和成果,對(duì)于推動(dòng)魚類基因組育種技術(shù)的應(yīng)用和種業(yè)發(fā)展具有重要意義。
截至2023年底,我國(guó)已完成并發(fā)表了60多種魚類的基因組測(cè)序和精細(xì)圖譜繪制論文,并基于這些基因組信息,開展了基因組進(jìn)化、比較基因組學(xué)以及功能基因組學(xué)研究,發(fā)現(xiàn)了dmrt1等性別決定基因,解析了魚類生長(zhǎng)發(fā)育、性別決定、抗病抗逆、變態(tài)、品質(zhì)等重要經(jīng)濟(jì)性狀的遺傳基礎(chǔ),并在此基礎(chǔ)上,研制了“魚芯1號(hào)”等魚類抗病育種基因芯片,建立了基因組選擇和基因編輯育種技術(shù),推動(dòng)了魚類良種培育進(jìn)程。
該綜述總結(jié)了中國(guó)魚類全基因組精細(xì)圖譜繪制、重要性狀的組學(xué)分析和基因組育種技術(shù)的研究現(xiàn)狀、進(jìn)展和未來(lái)發(fā)展方向,為水產(chǎn)研究學(xué)者、魚類育種學(xué)家和養(yǎng)殖從業(yè)人員提供了魚類基因組學(xué)研究和育種技術(shù)的綜合信息,有助于促進(jìn)魚類重要經(jīng)濟(jì)性狀的遺傳選育和良種創(chuàng)制,支撐魚類養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。
該綜述第一作者為黃海所周茜研究員,通訊作者為陳松林院士。綜述的撰寫和發(fā)表得到了國(guó)家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目、國(guó)家農(nóng)業(yè)生物育種重大專項(xiàng)、山東省重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃等項(xiàng)目的支持。
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https://doi.org/10.1007/s11427-023-2670-5