大黃魚是我國(guó)產(chǎn)量最高的海水養(yǎng)殖魚類,年產(chǎn)量超過25萬噸。隨著近幾年大黃魚產(chǎn)業(yè)的轉(zhuǎn)型升級(jí)以及深遠(yuǎn)海養(yǎng)殖的快速發(fā)展,優(yōu)良品種創(chuàng)制顯得尤為迫切。為解決產(chǎn)業(yè)難點(diǎn),創(chuàng)建深遠(yuǎn)海養(yǎng)殖大黃魚精準(zhǔn)高效育種技術(shù)體系,中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院東海水產(chǎn)研究所海水養(yǎng)殖生物育種與可持續(xù)產(chǎn)出全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室大黃魚遺傳育種團(tuán)隊(duì)成功研發(fā)“東海芯1號(hào)”大黃魚15K基因組育種芯片。這是東海所為培育適宜深遠(yuǎn)海養(yǎng)殖大黃魚新品種所特制的種業(yè)芯片,且檢測(cè)+預(yù)測(cè)周期小于14天,檢測(cè)成本不超百元。
“東海芯1號(hào)”育種芯片是基于大黃魚速生、高肌肉彈性和抗流選育參考群體(每個(gè)群體樣本數(shù)量均≥300尾)高深度重測(cè)序數(shù)據(jù)及2000余尾液相芯片分型數(shù)據(jù),結(jié)合GenoBaits?技術(shù)體系開發(fā)而成,包括1173個(gè)GWAS分析性狀關(guān)聯(lián)標(biāo)記,以及14119個(gè)基于遺傳連鎖關(guān)系挑選的基因組均勻分布的背景位點(diǎn)。該技術(shù)能夠?qū)崿F(xiàn)大黃魚快速、精準(zhǔn)、高效的分子育種,可加快育種過程,提高育種效率,進(jìn)一步推動(dòng)大黃魚種業(yè)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展。
“東海芯1號(hào)”芯片由東海所與博瑞迪聯(lián)合研發(fā),研發(fā)過程中得到了廈門大學(xué)徐鵬教授團(tuán)隊(duì)、中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院漁業(yè)工程研究所許建研究員團(tuán)隊(duì)的技術(shù)支持。該芯片具有基因組上均勻分布、高多態(tài)性等特點(diǎn),可以實(shí)現(xiàn)高效的群體劃分、分子標(biāo)記輔助選育、全基因組選擇等諸多功能,部分性狀基因組選擇預(yù)測(cè)準(zhǔn)確度最高可達(dá)0.66,證明該芯片在基因組選育中具有較好的應(yīng)用前景。
近年來,東海所深化大黃魚全產(chǎn)業(yè)鏈聯(lián)合攻關(guān),在育種方面與寧德市富發(fā)水產(chǎn)有限公司、廈門大學(xué)、中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院漁業(yè)工程研究所、浙江省舟山市水產(chǎn)研究所等單位合作,聚焦深遠(yuǎn)海養(yǎng)殖大黃魚種業(yè)需求,創(chuàng)制了多個(gè)大黃魚新種質(zhì)和新品系。