首個(gè)萬(wàn)份水稻群體變異圖譜發(fā)布

　　10月16日，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所聯(lián)合國(guó)內(nèi)多家高校和科研單位發(fā)布了首個(gè)萬(wàn)份水稻群體變異圖譜，為進(jìn)一步探究水稻群體遺傳和功能基因組研究提供了重要參考。相關(guān)研究成果發(fā)表在《核酸研究（Nucleic Acids Research）》上。

 

　　水稻是世界上最重要的糧食作物之一，其自然變異是基因改良和現(xiàn)代育種的重要遺傳基礎(chǔ)，從更大規(guī)模的水稻群體中鑒定基因組自然變異，挖掘稀有變異及其潛在應(yīng)用對(duì)水稻育種具有重要意義。

 

　　科研人員結(jié)合水稻超級(jí)泛基因組對(duì)一萬(wàn)多份水稻進(jìn)行了群體水平最大的自然變異分型，構(gòu)建了水稻超大規(guī)模的群體基因組變異數(shù)據(jù)集，并在此基礎(chǔ)上，將一萬(wàn)份群體重新劃分了亞群，糾正了部分水稻秈粳分類上的錯(cuò)誤；利用萬(wàn)份水稻群體變異，廣泛分析了重要功能基因在不同亞群中的群體頻率和豐富的等位基因型，鑒定了其中的優(yōu)異自然變異；建立了面向全球用戶的在線數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)，提供單倍型整合分析、變異圖譜分析和系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析等多個(gè)常用功能。該研究為開(kāi)展水稻的自然變異研究提供了重要方法參考和有力工具。

 

　　該研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金基礎(chǔ)科學(xué)中心、廣東省自然科學(xué)基金杰出青年基金、中國(guó)農(nóng)科院青年創(chuàng)新專項(xiàng)資金的支持。（通訊員 馬昕怡）

 

　　原文鏈接：https://doi.org/10.1093/nar/gkad840