近日,動物科技學(xué)院昝林森教授團隊和姜雨教授團隊合作完成了秦嶺羚牛染色體水平的基因組從頭組裝和注釋工作,揭示了秦嶺羚牛的分類學(xué)地位及其遺傳多樣性在“秦嶺四寶”中最低的特點。該研究成果以“Chromosome-level Genome Assembly for Takin (Budorcas taxicolor) Provides Insights into Its Taxonomic Status and Genetic Diversity”為標(biāo)題在線發(fā)表于知名學(xué)術(shù)期刊《Molecular Ecology》上,西北農(nóng)林科技大學(xué)李安寧副教授和博士研究生楊啟蒙為該論文共同第一作者,昝林森教授和姜雨教授為共同通訊作者。
秦嶺羚牛(Budorcas taxicolor bedfordi)與大熊貓(Ailuropoda melanoleuca)、金絲猴(Rhinopithecus avunculus)、朱鹮(Nipponia nippon)并稱“秦嶺四寶”。秦嶺羚牛,又叫金毛羚牛,屬國家一級重點保護動物,被世界自然保護聯(lián)盟(International Union for Conservation of Nature, IUCN)列為易危級物種?,F(xiàn)存種群數(shù)量不超過6000頭,主要分布在秦嶺山脈。然而關(guān)于羚牛在羊亞科中的生物學(xué)地位爭論頗多,尚無定論。
該研究通過基因組從頭測序,成功構(gòu)建了羚牛染色體水平的參考基因組(基因組大小為~2.95 Gb)。系統(tǒng)進化分析表明羚牛與麝牛的親緣關(guān)系最近,而不是綿羊或山羊等其它羊亞科動物。羚牛和北極的麝牛都屬于羊亞科中體型最大的動物,約于826萬年前分化開來。進一步的遺傳多樣性分析發(fā)現(xiàn)羚牛在“秦嶺四寶”中的遺傳多樣性最低,這些研究結(jié)果對羚牛的保護工作具有重要的科學(xué)價值。
該項目由我校和陜西省林科院野生動物繁育研究中心(珍稀野生動物救護基地)合作完成。感謝陜西長青國家級自然保護區(qū)管理局趙納勛高級工程師提供秦嶺羚牛的野外照片。該研究得到陜西省林業(yè)科技創(chuàng)新計劃專項(No. SXLK2021-0102、SXLK2020-0301)資助。
原文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/mec.16483