近日，西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)科學(xué)院動(dòng)物基因組與基因功能研究團(tuán)隊(duì)在中國(guó)家驢遺傳結(jié)構(gòu)和體型大小受選擇信號(hào)領(lǐng)域取得進(jìn)展，在《Journalof Genetics and Genomics》（中科院1區(qū)TOP期刊）上在線發(fā)表了題為《Genomic Analyses Reveal Distinct Genetic Architectures and Selective Pressures in Chinese Donkeys》的研究論文。我院在讀博士研究生沈加飛、于杰和代學(xué)雷為論文的第一作者，黨瑞華副教授為通訊作者。

 

　　該研究選取中國(guó)家驢12個(gè)代表性地方品種共78個(gè)樣本進(jìn)行全基因組重測(cè)序，結(jié)合從公共數(shù)據(jù)庫(kù)下載的11個(gè)野驢全基因組數(shù)據(jù)共同進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)中國(guó)家驢祖先來(lái)源比較單一，但在群體結(jié)構(gòu)上具有明顯的地理分布特征，分為華北平原驢、黃土高原驢和西南高原驢三類。

 

 

　　（A）家驢群體結(jié)構(gòu)；（B）家驢NJ樹(shù)；（C）家驢選擇信號(hào)與基因型分析

 

　　為揭示中國(guó)家驢體型差異的遺傳機(jī)制，研究人員對(duì)大型驢、中型驢和小型驢進(jìn)行受選擇分析，在家驢3號(hào)染色體上發(fā)現(xiàn)2個(gè)與體高發(fā)育密切相關(guān)的明星基因NCAPG和LCORL，分別有11個(gè)和5個(gè)錯(cuò)義突變位點(diǎn)，共同組成的基因型可以把大型驢與小型驢分開(kāi)。

 

　　該研究解析了中國(guó)家驢的群體遺傳結(jié)構(gòu)，篩選出影響中國(guó)家驢體型大小的關(guān)鍵候選基因與SNP錯(cuò)義突變位點(diǎn)，為揭示中國(guó)家驢地方品種的遺傳多樣性、品種形成的遺傳機(jī)制及品種改良提供了理論依據(jù)。

 

　　全文鏈接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1673852721001776