在國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃“藍(lán)色糧倉(cāng)”重點(diǎn)專(zhuān)項(xiàng)、黑龍江省自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的資助下,由黑龍江水產(chǎn)研究所鯉科魚(yú)類(lèi)基因組學(xué)科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)常玉梅等人開(kāi)展的“瓦氏雅羅魚(yú)高堿適應(yīng)Long Non-coding RNAs的鑒定與分析研究”取得重要進(jìn)展,相關(guān)研究成果“Identification and Analysis of Long Non-coding RNAs inLeuciscus waleckiiAdapted to Highly Alkaline Conditions”發(fā)表于《Frontiers in Physiology》(IF=4.566)(https://doi.org/10.3389/fphys.2021.665268)。
鰓和腎臟是負(fù)責(zé)調(diào)節(jié)廣鹽性硬骨魚(yú)體內(nèi)滲透環(huán)境動(dòng)態(tài)平衡的最重要的器官,為了探索lncRNAs在瓦氏雅羅魚(yú)高堿適應(yīng)過(guò)程中的潛在作用,本研究對(duì)不同堿度處理下的瓦氏雅羅魚(yú)鰓和腎組織進(jìn)行高通量測(cè)序,并結(jié)合已有的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對(duì)結(jié)果深入分析。研究發(fā)現(xiàn)大量與顯著差異表達(dá)lncRNAs表達(dá)模式相關(guān)的編碼基因富集于“transporter activity”、“response to stimulus”和“binding”等條目,這些基因與酸堿平衡、離子轉(zhuǎn)運(yùn)和氨氮排泄等調(diào)節(jié)密切相關(guān),表明lncRNAs對(duì)相關(guān)基因的調(diào)控在瓦氏雅羅魚(yú)的高堿適應(yīng)性過(guò)程中可能發(fā)揮重要作用。
該研究篩選得到的大量在瓦氏雅羅魚(yú)高堿適應(yīng)過(guò)程中發(fā)揮重要調(diào)控作用的表觀調(diào)控lncRNAs,為深入解析瓦氏雅羅魚(yú)高堿適應(yīng)的分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。