近日,國(guó)際著名學(xué)術(shù)期刊《PLoS Pathogens》發(fā)表了上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院魚類分子免疫學(xué)實(shí)驗(yàn)室的研究論文“Long noncoding RNA MARL regulates antiviral responses through suppression miR-122-dependent MAVS downregulation in lower vertebrates”。論文鏈接如下:https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1008670。該論文第一完成單位為上海海洋大學(xué),第一作者為初青博士,徐田軍教授為通訊作者。
長(zhǎng)鏈非編碼RNA(Longnon-coding RNA, lncRNA)是一類本身不編碼蛋白、轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度超過(guò)200nt的長(zhǎng)鏈非編碼RNA分子,它可在多層面上調(diào)控基因的表達(dá)。lncRNA最初被認(rèn)為是RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄的副產(chǎn)物,是一種“噪音”,不具有生物學(xué)功能。然而,近年來(lái)的研究表明,lncRNA參與了染色體修飾、基因組修飾、轉(zhuǎn)錄激活、轉(zhuǎn)錄干擾及核內(nèi)運(yùn)輸?shù)冗^(guò)程,其調(diào)控作用正在被越來(lái)越多的研究人員所關(guān)注。近年來(lái),在哺乳動(dòng)物中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)lncRNA能以多種作用機(jī)制調(diào)控機(jī)體的各項(xiàng)生理過(guò)程。魚類作為低等的脊椎動(dòng)物銜接了無(wú)脊椎動(dòng)物和高等脊椎動(dòng)物的進(jìn)化歷程,研究魚類的基因功能對(duì)于了解動(dòng)物的功能進(jìn)化具有重要意義。已經(jīng)有一些報(bào)道通過(guò)高通量測(cè)序發(fā)現(xiàn)魚類中也存在大量的lncRNA,但迄今為止,魚類中l(wèi)ncRNA的功能和作用機(jī)制尚不清楚。
作者首次在魚類中發(fā)現(xiàn)lncRNA可以作為ceRNA分子以競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合的分子機(jī)制調(diào)控靶基因的表達(dá)以達(dá)到調(diào)控信號(hào)通路的目的。具體來(lái)說(shuō)作者在研究中發(fā)現(xiàn)miRNA-122可以靶向結(jié)合RIG-I抗病毒信號(hào)通路中接頭分子MAVS的3'UTR區(qū)域進(jìn)而在轉(zhuǎn)錄后水平抑制MAVS的表達(dá),進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)了lncRNA MARL可以競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miRNA-122,進(jìn)而減弱了miRNA-122對(duì)MAVS的靶向抑制,最終提高了機(jī)體的抗病毒能力,闡明了魚類宿主與病毒之間以ceRNA機(jī)制調(diào)控RIG-I抗病毒信號(hào)通路的分子機(jī)制。
lncRNA MARL調(diào)控RIG-I信號(hào)通路的分子機(jī)制
長(zhǎng)期以來(lái),該課題組圍繞魚類的非編碼RNA開(kāi)展了系列研究,在國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊發(fā)表了多篇關(guān)于非編碼RNA調(diào)控魚類先天性免疫反應(yīng)的原創(chuàng)性論文,這是該課題組在前期microRNA研究基礎(chǔ)上進(jìn)一步加深魚類免疫信號(hào)通路調(diào)控機(jī)制研究的成果之一。