近日，國際著名學術期刊《PLoS Pathogens》發(fā)表了上海海洋大學水產與生命學院魚類分子免疫學實驗室的研究論文“Long noncoding RNA MARL regulates antiviral responses through suppression miR-122-dependent MAVS downregulation in lower vertebrates”。論文鏈接如下：https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1008670。該論文第一完成單位為上海海洋大學，第一作者為初青博士，徐田軍教授為通訊作者。
長鏈非編碼RNA（Longnon-coding RNA, lncRNA）是一類本身不編碼蛋白、轉錄本長度超過200nt的長鏈非編碼RNA分子，它可在多層面上調控基因的表達。lncRNA最初被認為是RNA聚合酶II轉錄的副產物，是一種“噪音”，不具有生物學功能。然而，近年來的研究表明，lncRNA參與了染色體修飾、基因組修飾、轉錄激活、轉錄干擾及核內運輸等過程，其調控作用正在被越來越多的研究人員所關注。近年來，在哺乳動物中已經發(fā)現lncRNA能以多種作用機制調控機體的各項生理過程。魚類作為低等的脊椎動物銜接了無脊椎動物和高等脊椎動物的進化歷程，研究魚類的基因功能對于了解動物的功能進化具有重要意義。已經有一些報道通過高通量測序發(fā)現魚類中也存在大量的lncRNA，但迄今為止，魚類中l(wèi)ncRNA的功能和作用機制尚不清楚。
作者首次在魚類中發(fā)現lncRNA可以作為ceRNA分子以競爭性結合的分子機制調控靶基因的表達以達到調控信號通路的目的。具體來說作者在研究中發(fā)現miRNA-122可以靶向結合RIG-I抗病毒信號通路中接頭分子MAVS的3'UTR區(qū)域進而在轉錄后水平抑制MAVS的表達，進一步發(fā)現了lncRNA MARL可以競爭性結合miRNA-122，進而減弱了miRNA-122對MAVS的靶向抑制，最終提高了機體的抗病毒能力，闡明了魚類宿主與病毒之間以ceRNA機制調控RIG-I抗病毒信號通路的分子機制。
lncRNA MARL調控RIG-I信號通路的分子機制
長期以來，該課題組圍繞魚類的非編碼RNA開展了系列研究，在國際權威學術期刊發(fā)表了多篇關于非編碼RNA調控魚類先天性免疫反應的原創(chuàng)性論文，這是該課題組在前期microRNA研究基礎上進一步加深魚類免疫信號通路調控機制研究的成果之一。
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