7月5日,中國(guó)科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心/植物生理生態(tài)研究所國(guó)家基因研究中心韓斌研究組與上海師范大學(xué)黃學(xué)輝研究組、中國(guó)水稻所和福建農(nóng)科院合作在《自然-通訊》(Nature Communications)雜志上發(fā)表了題為Dissecting a heterotic gene through GradedPool-Seq mapping informs a rice-improvement strategy 的研究論文。該研究開(kāi)發(fā)了一種新的數(shù)量性狀(QTL)定位方法,并快速克隆到水稻產(chǎn)量性狀雜種優(yōu)勢(shì)基因GW3p6(OsMADS1),為雜種優(yōu)勢(shì)育種和品種改良提供了新的策略。
雜種優(yōu)勢(shì)育種極大地提高了糧食產(chǎn)量,為解決糧食危機(jī)做出了巨大貢獻(xiàn)。該研究組之前的工作已經(jīng)揭示了水稻產(chǎn)量相關(guān)的雜種優(yōu)勢(shì)遺傳機(jī)制:雜種優(yōu)勢(shì)的遺傳機(jī)制不是由于雙親基因“雜”產(chǎn)生的超顯性互作效應(yīng),而是主要基于雙親優(yōu)良基因以顯性和不完全顯性的聚合效應(yīng)。然而,與水稻產(chǎn)量雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)的優(yōu)良基因所知甚少,之前尚沒(méi)有水稻雜種優(yōu)勢(shì)基因(Heterotic gene)或QTL被克隆,其中一部分原因就是克隆雜種優(yōu)勢(shì)基因非常耗時(shí)耗力。
韓斌研究組以此為出發(fā)點(diǎn),開(kāi)發(fā)了一套新的數(shù)量性狀基因定位方法—GradedPool-Seq(GPS)。該方法基于F2樣品材料混合池測(cè)序的策略,直接從表型差異大的雙親F2后代中精確定位基因。該方法不僅提高了定位基因的分辨率,而且大幅度降低了成本。通過(guò)該方法,成功在多套雜交稻群體中定位到已知與未知的雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)基因,并且在“廣兩優(yōu)676”雜交稻F2群體中定位到與千粒重相關(guān)的雜種優(yōu)勢(shì)基因GW3p6。進(jìn)一步圖位克隆發(fā)現(xiàn)來(lái)自于雄性不育系(母本)中的GW3p6是OsMADS1的等位基因,并且GW3p6剪切方式的改變?cè)斐闪V嘏c產(chǎn)量的增加。通過(guò)構(gòu)建近等基因系發(fā)現(xiàn),GW3p6顯著提高水稻產(chǎn)量、增加粒重和粒長(zhǎng),但是不影響其他農(nóng)藝性狀。同時(shí)將GW3p6與另一個(gè)分蘗相關(guān)雜種優(yōu)勢(shì)基因PN3q23聚合,進(jìn)一步提高了水稻產(chǎn)量。這些結(jié)果證明在自交系中聚合優(yōu)良的純合型雜種優(yōu)勢(shì)基因,可以不通過(guò)培育雜交稻的方式,同樣實(shí)現(xiàn)雜種優(yōu)勢(shì)類(lèi)似的產(chǎn)量增加。另外GPS方法與該研究也為雜種優(yōu)勢(shì)育種以及品種改良提供了新的高效設(shè)計(jì)育種思路。
分子植物卓越中心博士生王長(zhǎng)盛和唐詩(shī)燦為該論文的共同第一作者,韓斌與黃學(xué)輝為共同通訊作者。該研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金和中科院先導(dǎo)B項(xiàng)目的資助。
論文鏈接
圖:A)GPS定位QTL的流程;B)雜種優(yōu)勢(shì)基因定位及設(shè)計(jì)育種示意圖(彩色圓點(diǎn)代表優(yōu)良基因)