近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蜜蜂研究所聯(lián)合首都師范大學(xué)等單位,構(gòu)建了首個(gè)東方蜜蜂的泛基因組序列,并揭示了結(jié)構(gòu)變異在東方蜜蜂演化與環(huán)境適應(yīng)性方面的作用。相關(guān)研究成果發(fā)表在《分子生態(tài)資源(Molecular Ecology Resources)》上。
東方蜜蜂是一種具有重要生態(tài)與經(jīng)濟(jì)價(jià)值的傳粉昆蟲(chóng),對(duì)其遺傳變異進(jìn)行解析有助于理解其種群動(dòng)態(tài)、演化規(guī)律以及環(huán)境適應(yīng)能力。然而,迄今為止的研究局限于使用單一的參考基因組序列來(lái)研究小尺度的遺傳變異,忽略了大尺度的基因組變異。
本研究采用三代測(cè)序技術(shù)為東方蜜蜂的祖先群體創(chuàng)制了染色體水平的參考基因組序列,結(jié)合525個(gè)基因組重測(cè)序數(shù)據(jù),構(gòu)建出東方蜜蜂的首個(gè)泛基因組序列。研究發(fā)現(xiàn),超過(guò)30%的東方蜜蜂的基因在不同群體間存在變異,這些可變基因很可能為蜜蜂適應(yīng)不同的環(huán)境條件提供了豐富的基因庫(kù)。本研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),大尺度的結(jié)構(gòu)變異是獨(dú)立于小尺度的點(diǎn)突變之外的遺傳變異類(lèi)型。通過(guò)關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn),有44個(gè)結(jié)構(gòu)變異與環(huán)境因子高度連鎖,實(shí)驗(yàn)表明其中一個(gè)結(jié)構(gòu)變異很可能通過(guò)降低臨近基因的表達(dá)來(lái)促進(jìn)我國(guó)阿壩地區(qū)的東方蜜蜂適應(yīng)當(dāng)?shù)氐暮洵h(huán)境。本研究不僅豐富了東方蜜蜂的基因組學(xué)資源,而且為將來(lái)的種質(zhì)資源保護(hù)與遺傳改良提供有價(jià)值的基因信息。
該研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金與中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)的資助。