近日,國(guó)際知名雜志Emerging Microbes & Infections(IF=19.568)發(fā)表了畜牧獸醫(yī)所聯(lián)合山東第一醫(yī)科大學(xué)等單位合作研究成果:Identification of a recombinant equine coronavirus in donkey, China。該研究首次在我國(guó)驢群中發(fā)現(xiàn)馬冠狀病毒(ECoV),研究人員獲得了病毒全基因組序列并進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,為ECoV跨宿主感染驢和在馬屬動(dòng)物中監(jiān)測(cè)ECoV提供了證據(jù)及理論依據(jù)。畜牧獸醫(yī)所為第一產(chǎn)權(quán)單位,草食動(dòng)物疫病防控創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)齊鵬飛為第一作者,張偉和山東第一醫(yī)科大學(xué)史衛(wèi)峰為本文共同通訊作者。
ECoV和SARS-CoV、SARS-CoV-2、MERS-CoV均是β冠狀病毒屬成員,其中ECoV屬于Embecovirus亞屬。本研究基于RT-qPCR從兩例腹瀉驢駒的小腸樣本中檢測(cè)出ECoV,通過細(xì)胞培養(yǎng)及電鏡觀察發(fā)現(xiàn)樣本中存在典型的CoV病毒顆粒(圖1)。研究人員對(duì)兩例陽性樣本進(jìn)行高通量測(cè)序,通過序列組裝和比對(duì)獲得了兩條ECoV全基因組序列。序列分析表明,新發(fā)現(xiàn)的兩株ECoV基因組序列完全一致,與數(shù)據(jù)庫(kù)中的ECoV比對(duì)發(fā)現(xiàn)相似性最高的是ECoV NC99(圖2)。對(duì)ECoV新毒株和代表毒株進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析表明,盡管新毒株和已知ECoV位于同一個(gè)大的分支,但又存在明顯的區(qū)分(圖3)。進(jìn)一步的重組分析發(fā)現(xiàn)該毒株NS2基因附近存在重組現(xiàn)象,推測(cè)為新型重組突變株,這是我國(guó)科研人員首次在國(guó)內(nèi)驢群中發(fā)現(xiàn)分離鑒定出ECoV。該研究得到山東省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系、山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院創(chuàng)新工程和山東第一醫(yī)科大學(xué)學(xué)術(shù)提升計(jì)劃等項(xiàng)目的資助。
?。ㄎ恼骆溄樱篽ttps://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2022.2056522)