2021年9月30日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹研究所漿果類果樹栽培與生理創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在植物科學(xué)JCR一區(qū)期刊《Frontiers in Plant Science》(即時IF:5.75)在線發(fā)表了題為“Single-Molecule Real-Time and Illumina Sequencing to Analyze Transcriptional Regulation of Flavonoid Synthesis in Blueberry”的研究論文,該論文解析了MYB基因在藍(lán)莓果實(shí)花青素積累方面具有重要的調(diào)控作用。
該研究以‘Duke’品種為試材,首次利用SMRT結(jié)合Illumina技術(shù)對不同發(fā)育階段果實(shí)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,從中挖掘出多個MYB基因,它們分別在不同果實(shí)發(fā)育時期具有不同的表達(dá)模式。通過系統(tǒng)進(jìn)化分析、結(jié)構(gòu)域分析、基因表達(dá)模式分析,以及利用同源和異源遺傳轉(zhuǎn)化等方法,明確了VcMYB1具有調(diào)控花青素合成的生物學(xué)功能。進(jìn)一步利用酵母雜交、EMSA和啟動子激活等試驗(yàn),解析了VcMYB1通過與花青素合成結(jié)構(gòu)基因VcDFR啟動子上特異位點(diǎn)相結(jié)合,正向調(diào)控該基因的表達(dá),從而促進(jìn)花青素的合成和積累。該研究系統(tǒng)闡釋了藍(lán)莓果實(shí)中黃酮類化合物的合成途徑,并深入探討了花青素合成的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,為研究藍(lán)莓果實(shí)中次生代謝產(chǎn)物合成途徑提供了豐富的背景資料和數(shù)據(jù)資源。
果樹所宋楊副研究員為該論文通訊作者,碩士生唐琦為第一作者。該研究得到遼寧省自然科學(xué)基金(2019-MS-348)、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程(CAAS-ASTIP-2016-RIP)和中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)等項(xiàng)目的資助。