近日,中國水產(chǎn)科學(xué)研究院生物技術(shù)研究中心在鯉抵抗嗜水氣單胞菌感染的分子機(jī)制方面取得新進(jìn)展,相關(guān)研究論文“Genomic features of common carp that are relevant for resistance against Aeromonas hydrophila infection”發(fā)表于水產(chǎn)類1區(qū)雜志《Aquaculture》(2020年JCR1區(qū),IF=4.242)。該論文得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(2018YFD0900102)和中國水產(chǎn)科學(xué)研究院中央級(jí)公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)資金(2018B003和2020TD24)資助。江炎亮副研究員為文章的第一及通訊作者,許建研究員為共同通訊作者。文章鏈接網(wǎng)址:https://authors.elsevier.com/sd/article/S0044-8486(21)01175-3.
嗜水氣單胞菌是鯉魚養(yǎng)殖中危害最嚴(yán)重的致病菌之一。研究人員對(duì)易感和抗病的鯉魚進(jìn)行全基因組重測(cè)序并開展全基因組關(guān)聯(lián)分析,定位到8個(gè)與抗病性狀顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn)(圖1),并進(jìn)一步找到6個(gè)潛在關(guān)鍵基因,均為免疫相關(guān)基因:rab26,dcc,trim71,ptpn21,muc5b,trim25。8個(gè)顯著關(guān)聯(lián)的SNP中,有1個(gè)為非同義SNP,位于基因trim25的外顯子區(qū)域,可引發(fā)Trim25蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)的改變(圖2),且該基因在經(jīng)嗜水氣單胞菌感染后的鯉魚脾臟中顯著上調(diào)表達(dá)。研究結(jié)果表明鯉在基因組水平上的遺傳差異決定了其抵抗細(xì)菌感染的能力強(qiáng)弱,為全基因組選育鯉抗病新品系提供了必要的分子基礎(chǔ)。
圖1. Manhattan 結(jié)果展示圖
圖2. Trim25 蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)