近日,四川農(nóng)業(yè)大學(xué)李仕貴教授團(tuán)隊(duì)在中科院一區(qū)TOP期刊《作物學(xué)報(英文版)》(The Crop Journal)在線發(fā)表了題為《TAW1的自然等位基因有助于提高水稻的穗粒數(shù)和產(chǎn)量》(A natural allele ofTAW1contributes to high grain number and grain yield in rice)的研究論文。該項(xiàng)研究從構(gòu)建到發(fā)現(xiàn)再到如今的發(fā)表,歷時十二年。該研究中作者通過QTL定位,鑒定到一個已克隆穗粒數(shù)基因TAW1的自然等位基因,對育種利用具有重要的價值。
穗粒數(shù)是直接決定水稻產(chǎn)量的因素之一,鑒定穗粒數(shù)相關(guān)基因或QTL位點(diǎn)對提高水稻產(chǎn)量具有重要意義。目前已經(jīng)有大量穗粒數(shù)相關(guān)基因被克隆,但是大多數(shù)基因是通過突變體材料進(jìn)行鑒定,難以直接在育種中利用。因此,發(fā)掘穗粒數(shù)相關(guān)基因的自然優(yōu)異等位基因具有重要意義。
該研究中作者利用重穗型雜交稻骨干親本蜀恢498(R498)為受體,一個穗更長的秈稻品種WY11327為供體構(gòu)建了一套染色體片段代換系,其中鑒定到一個穗長達(dá)38cm的代換系F771。通過構(gòu)建分離定位群體、遺傳分析、QTL-seq定位及候選基因分析,確定位于第10染色體的qPLN10(Panicle Length and Grain Number 10)的候選基因是已克隆的穗粒數(shù)基因TAW1。進(jìn)一步通過分子標(biāo)記篩選分離到該基因的近等基因系NIL-TAW1,與R498相比,NIL-TAW1穗長和穗粒數(shù)顯著增加,最終單株產(chǎn)量顯著增加(圖1),說明該基因的自然變異具有重要的育種利用價值。單倍型分析發(fā)現(xiàn),該優(yōu)異單倍型Hap13主要存在于aus資源中,而在秈稻和粳稻中比例非常少(圖2),推測該優(yōu)異單倍型可能來源于aus,對指導(dǎo)改良秈稻和粳稻品種的穗長和穗粒數(shù)性狀,提高水稻產(chǎn)量具有重要意義。
袁華博士、碩士研究生許正艷和譚雪琴為本文共同第一作者,馬炳田教授和陳薇蘭博士為共同通訊作者。本研究得到國家轉(zhuǎn)基因科技重大專項(xiàng)子課題“新株型超級稻”秈稻品種的培育(2016ZX08001004-002)和國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(2016YFD0100406)的資助。