中國(guó)熱科院發(fā)布西番蓮染色體級(jí)別精細(xì)基因組

　　近日，中國(guó)熱科院?？?a href='http://m.unionsn.com/tag_4793.html' class='zdbq' title='實(shí)驗(yàn)相關(guān)食品資訊' target='_blank'>實(shí)驗(yàn)站西番蓮育種高效栽培研究團(tuán)隊(duì)在西番蓮染色體級(jí)別基因組解析和風(fēng)味物質(zhì)合成機(jī)理研究方面取得重要進(jìn)展。

 

　　研究團(tuán)隊(duì)利用Illumina、Nanopore、Hi-C測(cè)序，采用NextDenovo + SMARTdenovo + NextPolish策略組裝，獲得~1341.7 Mb的基因組，經(jīng)與其它19種近緣植物基因家族比較分析，發(fā)現(xiàn)西番蓮與大戟科（蓖麻，橡膠樹和木薯）親緣關(guān)系最密切，發(fā)布西番蓮染色體級(jí)別基因組，明確百香果的進(jìn)化地位；此外，從基因組、轉(zhuǎn)錄組和代謝組等多組學(xué)角度挖掘了影響西番蓮風(fēng)味的潛在基因和基因家族，明確α-亞麻酸代謝、代謝途徑和次生代謝途徑是參與西番蓮風(fēng)味形成過程中重要揮發(fā)性有機(jī)物（VOCs）合成的主要途徑，為西番蓮的改良栽培提供寶貴的資源。

 

　　該項(xiàng)工作相關(guān)研究結(jié)果，以題為：“Chromosome-scale genome assembly provides insights into the evolution and flavor synthesis of passion fruit （Passiflora edulis Sims） ”在中科院JCR一區(qū)的TOP期刊《Horticulture Research》發(fā)表。中國(guó)熱科院?？趯?shí)驗(yàn)站黃東梅助理研究員、海南大學(xué)夏志強(qiáng)副教授、齊魯工業(yè)大學(xué)張圣奎博士為共同第一作者，中國(guó)熱科院?？趯?shí)驗(yàn)站宋順副研究員、詹儒林研究員為通訊作者。該項(xiàng)工作得到了中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院專項(xiàng)資金支持。

 

　　文章鏈接：https://www.nature.com/articles/s41438-020-00455-1