在973計劃的支持下,中國農(nóng)業(yè)科學院蔬菜花卉研究所黃三文研究員的研究團隊構(gòu)建了包含360多萬個位點的黃瓜全基因組遺傳變異圖譜,為全面了解黃瓜這一重要蔬菜作物的進化及多樣性提供了新思路,并為全基因組設(shè)計育種打下了基礎(chǔ)。該研究成果于10月21日由《自然 遺傳學》雜志在線發(fā)表。
黃瓜是最重要的蔬菜之一,相比其他園藝作物有著較小的基因組,因此常被用來作為研究植物或者蔬菜重要經(jīng)濟性狀形成的重要模式系統(tǒng)。在該研究中,科研團隊對115個黃瓜品系進行了重測序,并對一個野生黃瓜進行了從頭測序。他們共發(fā)現(xiàn)330多萬個單核苷酸多態(tài)性位點(SNPs),33萬多個小插入和刪除,594個獲得/缺失變異?;谶@些數(shù)據(jù),研究人員構(gòu)建了一個單核苷酸分辨率的黃瓜遺傳變異圖譜。利用該遺傳變異圖譜,科學家證實了黃瓜發(fā)源于印度,同時將控制葉片、果實大小以及苦味等性狀的關(guān)鍵基因定位在了染色體上,為下一步利用這些重要蔬菜馴化基因打下了基礎(chǔ)。
973計劃2012年設(shè)立重大項目“主要蔬菜重要品質(zhì)性狀形成的遺傳機理與分子改良”,兩年來在蔬菜重要性狀形成方面取得一系列進展。黃瓜變異組圖譜將進一步促進蔬菜作物生物學研究,為提高我國蔬菜育種的核心競爭力、促進民族種業(yè)的跨越性發(fā)展奠定了堅實基礎(chǔ)。