近日,珠江水產(chǎn)研究所觀賞漁業(yè)研究室牟希東研究員等發(fā)明設(shè)計的“一種魚類核基因分子標(biāo)記引物、分子標(biāo)記及分子標(biāo)記數(shù)據(jù)庫”獲國家發(fā)明專利授權(quán),專利號為:ZL202210345227.4。
本發(fā)明公開了一種魚類通用型核基因分子標(biāo)記引物、分子標(biāo)記及分子標(biāo)記數(shù)據(jù)庫。利用132種魚類全基因組數(shù)據(jù)對比,根據(jù)PCR引物特異性和PCR擴(kuò)增率對31個目203個物種的PCR擴(kuò)增率進(jìn)行進(jìn)一步篩選,最終開發(fā)了82個通用型核基因分子標(biāo)記(FishPIE),并且所設(shè)計的分子標(biāo)記引物集整體PCR成功率高達(dá)于80%,同時建立了分子數(shù)據(jù)庫。本發(fā)明篩選出大量的通用型核基因分子標(biāo)記,一方面有利于種質(zhì)資源保護(hù),另一方面,在該類分子標(biāo)記基礎(chǔ)上可構(gòu)建魚類核基因數(shù)據(jù)庫并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹、分類,從而實現(xiàn)對魚類的快速種質(zhì)鑒定,在保障準(zhǔn)確率的前提下,降低了現(xiàn)有技術(shù)耗時、費力、成本高的問題。另外,用于魚類的遺傳進(jìn)化研究,比如利用FishPIE標(biāo)記構(gòu)建了魚類60個目190個科710種魚類的系統(tǒng)發(fā)育樹,產(chǎn)生了與使用數(shù)百個標(biāo)記的系統(tǒng)發(fā)育研究相當(dāng)?shù)姆直媛剩∕u et al., 2022, iScience)。