雜交與漸滲在野生植物中廣泛存在,并對物種形成與適應(yīng)性進(jìn)化產(chǎn)生重要影響,一直以來都是進(jìn)化生物學(xué)和生物多樣性研究的熱點(diǎn)。然而,物種之間的頻繁雜交與漸滲使得重建物種系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系非常困難。遺傳重組是產(chǎn)生變異的主要驅(qū)動(dòng)力量之一,在生物進(jìn)化過程中起著極其重要的作用。然而,重組率變異如何影響系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和雜交漸滲尚不清楚。野生二倍體草莓是重要的作物野生近緣種,廣泛分布于世界溫帶地區(qū),中國是其多樣性分布中心與起源中心之一,蘊(yùn)藏非常豐富的遺傳變異,具有重要的發(fā)掘利用價(jià)值。
華南植物園康明研究團(tuán)隊(duì)利用全基因組重測序數(shù)據(jù)重建了10個(gè)野生二倍體草莓(占所有野生二倍體草莓的83%)的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,探討了重組率變化對系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和基因組漸滲的影響,發(fā)現(xiàn)低重組率的基因組區(qū)域具有更低的雜交漸滲與不完全譜系分選,以及更一致的系統(tǒng)發(fā)育信號,可以反映更真實(shí)的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。野生二倍體草莓存在復(fù)雜且廣泛的雜交漸滲,物種間平均漸滲率約占整個(gè)基因組的4.1%。漸滲更傾向于保留在高重組、低基因密度的基因組區(qū)域。祖先態(tài)模擬揭示了自交不親和性狀丟失后而重新獲得。同時(shí)發(fā)現(xiàn)自交不親和性狀的重新獲得可能與受到正選擇的控制花粉識別的SLF基因的歷史漸滲有關(guān)。該研究為野生二倍體草莓的進(jìn)化歷史和雜交漸滲的基因組特征提供了新視角,為雜交漸滲在植物交配系統(tǒng)轉(zhuǎn)變中的作用提供了新證據(jù)。
上述研究成果已在線發(fā)表于進(jìn)化生物學(xué)頂級刊物Molecular Biology and Evolution(《分子生物學(xué)與進(jìn)化》)。中科院華南植物園馮超副研究員和江蘇省農(nóng)科院果樹所王靜研究員為論文共同第一作者,華南植物園康明研究員為論文通訊作者,美國俄勒岡州立大學(xué)Aaron Liston教授參與了研究工作。該研究得到了國家自然科學(xué)基金、中科院青促會(huì)項(xiàng)目和華南植物園青年人才專項(xiàng)等項(xiàng)目的資助。文章鏈接:https://academic.oup.com/mbe/advance-article/doi/10.1093/molbev/msad049/7067769