近日,中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院南海水產(chǎn)研究所院級(jí)海灣與島礁水域生態(tài)保護(hù)與修復(fù)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在利用宏基因組測(cè)序技術(shù)分析中國(guó)南海北部近海細(xì)菌、原生動(dòng)物和硅藻多樣性及其垂直分布格局方面取得階段性成果,為近海海洋生態(tài)系統(tǒng)研究提供了基礎(chǔ)資料。該研究成果論文以“Distributional Pattern of Bacteria, Protists, and Diatoms in Ocean according to Water Depth in the Northern South China Sea”為題發(fā)表在Microbiology Spectrum(JCR Q1)上。
海洋細(xì)菌、原生動(dòng)物和微藻是海洋生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,在海洋物質(zhì)循環(huán)和能量流動(dòng)中發(fā)揮重要作用。它們的群落結(jié)構(gòu)、多樣性格局和功能變化會(huì)對(duì)整個(gè)微食物網(wǎng)及近岸淺海生態(tài)系統(tǒng)產(chǎn)生影響。因?qū)Q蟓h(huán)境變化敏感,許多種類(lèi)的海洋微生物、原生動(dòng)物和硅藻可作為水污染指示生物。南海北部海域聚集了北部灣、珠江河口、粵東漁場(chǎng)等,孕育著豐富的漁業(yè)資源,為海洋生物提供了良好的棲息繁殖環(huán)境;同時(shí),該海域也是受人類(lèi)活動(dòng)影響較頻繁的區(qū)域。據(jù)此,南海所創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)以南海北部近海細(xì)菌、原生動(dòng)物和硅藻為對(duì)象,對(duì)其多樣性、分布特征及其與環(huán)境因子的關(guān)系進(jìn)行研究,闡釋其群落動(dòng)態(tài)、結(jié)構(gòu)功能的重要性和潛在的生態(tài)作用。
該創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)基于宏基因組測(cè)序方法,評(píng)估了不同水深海洋細(xì)菌、原生動(dòng)物和硅藻群落和功能的變化。結(jié)果顯示,硅藻的物種豐富度(α多樣性)和群落組成(β多樣性)與水深呈顯著正相關(guān)關(guān)系(P<0.05),可能與水下光強(qiáng)波動(dòng)有關(guān);而細(xì)菌和原生動(dòng)物的物種豐富度與水深相關(guān)性不顯著(P>0.05),未表現(xiàn)出明顯的垂直分布規(guī)律。此外,鹽度升高對(duì)某些硅藻和細(xì)菌類(lèi)群的豐度有負(fù)面影響。北部灣、珠江河口硅藻豐度與鹽度顯著相關(guān)(P<0.05),珠江河口硅藻豐度與水深、硅酸鹽等也顯著相關(guān)(P<0.05)。對(duì)24個(gè)宏基因組的LEfSe分析,不同水深樣品KEGG代謝途徑基因存在差異表達(dá),其中6種(包括類(lèi)黃酮類(lèi)、二苯乙烯類(lèi)、二芳基庚烷類(lèi)和姜辣素生物合成)在40m處富集,3種在10m處富集,反映了近海不同水深(0~200m)海洋細(xì)菌功能的淺層差異。
該研究得到廣東省基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究重大項(xiàng)目課題(2019B030302004-05),廣東省基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究基金項(xiàng)目(2019B1515120065)、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部財(cái)政專(zhuān)項(xiàng)(NFZX2021),中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院中央級(jí)公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專(zhuān)項(xiàng)(2020TD16),中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院南海水產(chǎn)研究所中央級(jí)公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專(zhuān)項(xiàng)(2021SD04)等項(xiàng)目資助。
論文獲取鏈接:https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.02759-21