近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所肉羊遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了光周期誘導(dǎo)下卵巢摘除及雌激素處理(OVX+E2)綿羊甲狀腺circRNAs圖譜,揭示了甲狀腺組織中在不同光周期下差異表達(dá)的關(guān)鍵circRNAs及其調(diào)控機(jī)制。相關(guān)研究成果發(fā)表于《內(nèi)分泌學(xué)前沿(Frontiers in Endocrinology)》上。
據(jù)肉羊遺傳育種團(tuán)隊(duì)儲(chǔ)明星介紹,綿羊的季節(jié)性繁殖受光周期等外界環(huán)境長期選擇而形成,光周期變化是影響綿羊季節(jié)性繁殖的關(guān)鍵因素。環(huán)狀RNAs(circRNAs)是新發(fā)現(xiàn)的非編碼RNAs,在RNA調(diào)控中發(fā)揮重要作用。本研究基于OVX+E2模型探討光周期對(duì)綿羊甲狀腺的影響機(jī)制,為研究光周期調(diào)控綿羊季節(jié)性發(fā)情奠定理論基礎(chǔ)。
該研究通過全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)θN不同光周期下OVX+E2母羊甲狀腺中的circRNA圖譜進(jìn)行了全面分析,共檢測(cè)到37470個(gè)新的circRNAs,其中817個(gè)circRNAs有差異表達(dá)。對(duì)差異表達(dá)circRNAs進(jìn)行功能富集注釋分析,發(fā)現(xiàn)主要在肌醇磷酸代謝、cGMP-PKG信號(hào)通路、鈣信號(hào)通路、MAPK信號(hào)通路和卵細(xì)胞減數(shù)分裂等與繁殖相關(guān)的通路富集。同時(shí)構(gòu)建ceRNA網(wǎng)絡(luò)互作圖,分析揭示了差異cirRNA的miRNA目標(biāo)結(jié)合位點(diǎn),如oar-miR-10b、oar-miR-200c、oar-miR-21、oar-miR-370-3p、oar-miR-377-3p、oar-miR-181a、oar-miR-432和oar-miR-495-3p。本研究結(jié)果為闡明circRNA功能以及不同環(huán)境下綿羊甲狀腺作用提供了一些新的信息。
本研究得到國家自然科學(xué)基金、國家肉羊產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系和中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程等支持。碩士研究生王唯和助理研究員賀小云為文章第一作者,儲(chǔ)明星研究員為通訊作者。
原文鏈接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fendo.2022.974518/full