8月30日,中國科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心研究員張鵬研究組與中科院分子細胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心研究員陳洛南研究組合作,在The Plant Journal上發(fā)表了題為Dynamic network biomarker analysis discovers IbNAC083 in initiation and regulation of sweet potato root tuberization的研究論文。研究通過動態(tài)網(wǎng)絡(luò)生物標(biāo)記(dynamic network biomarker, DNB)分析,揭示出甘薯根膨大過程中的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子以及調(diào)控機制。
甘薯是重要薯類作物,其儲藏根的起始和發(fā)育對產(chǎn)量和品質(zhì)的形成十分重要,而分子機制尚不清楚。因此,確定從膨大起始到儲藏根形成的臨界點,并鑒定出核心轉(zhuǎn)錄因子是研究的關(guān)鍵。研究人員通過對甘薯根發(fā)育過程中的轉(zhuǎn)錄組動力學(xué)進行DNB分析,確定了相當(dāng)大比例(>9%)甘薯基因的階段特異性表達模式,以及根發(fā)育早期和后期發(fā)生的重要事件,獲得S10(直徑3.5mm)時期為決定儲藏根命運的關(guān)鍵時期,建立了儲藏根發(fā)育的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò);此外,研究鑒定出關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子IbNAC083為其核心起始因子,發(fā)現(xiàn)IbNAC083通過影響木質(zhì)素、黃酮醇和淀粉的生物合成進而影響儲藏根膨大的起始。
研究工作得到國家重點研發(fā)計劃和國家自然科學(xué)基金等的資助。
甘薯膨大過程關(guān)鍵時期IbNAC083關(guān)聯(lián)基因的反轉(zhuǎn)表達與調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分子模型