溫度是影響水稻品種形成和地域分布的主要環(huán)境因子。亞洲栽培稻分為秈稻和粳稻兩個亞種,秈稻低溫耐受性較弱,主要分布在我國華南和淮河以南的熱帶/亞熱帶地區(qū);粳稻低溫耐受性較強,主要分布于我國北部和東北部。目前,學界對秈、粳稻低溫耐受性差異的分子基礎已有一定的了解,低溫感受器編碼基因COLD1在秈、粳稻之間存在明顯差異,COLD1中單個核苷酸變化能夠明顯改變水稻的耐寒性。低溫感受器下游信號通路眾多,但哪些調(diào)控途徑在秈/粳稻耐寒性差異形成中發(fā)揮關鍵作用尚不清楚。
中國科學院院士、中科院植物研究所研究員種康課題組繼發(fā)現(xiàn)水稻低溫感受器COLD1之后,致力于解析其下游調(diào)控途徑。研究人員通過多組學分析發(fā)現(xiàn),維生素E-維生素K1亞網(wǎng)絡是COLD1下游低溫應答通路,也是秈、粳稻低溫耐受性差異形成的關鍵調(diào)控點。研究人員從粳稻日本晴為供體的秈稻93-11單片段代換系入手,選取低溫耐受性提升至近粳稻水平的代換系,基因組序列分析表明COLD1位于代換片段區(qū)域;轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn),代換系與日本晴中低溫應答變化規(guī)律相似的通路集中于泛醌/萜醌代謝網(wǎng)絡(包括維生素合成途徑);代謝組分析進一步聚焦到葉綠體中維生素E和維生素K1代謝途徑;轉(zhuǎn)錄/代謝雙組學相關性網(wǎng)絡分析表明,維生素E-維生素K1亞網(wǎng)絡是代換系低溫耐受性提升的核心調(diào)控點。轉(zhuǎn)基因材料分析驗證此亞網(wǎng)絡確為COLD1下游途徑。研究人員通過多組學與遺傳材料相結合的分析手段,揭示了低溫信號被植物感知后的下游傳導途徑,挖掘了秈粳不同低溫耐受性形成的關鍵調(diào)控點,為水稻耐寒分子育種奠定了理論基礎并供可操作的靶點和材料。
該研究成果于7月20日在線發(fā)表于Cell Reports。該研究得到中科院戰(zhàn)略性先導科技專項和國家自然科學基金委員會的資助。
粳、秈稻不同耐寒性調(diào)控途徑示意圖。COLD1下游位于葉綠體的維生素E-維生素K1亞網(wǎng)絡低溫應答模式的差異導致粳、秈稻分別呈現(xiàn)強、弱耐寒性。金黃色字體和藍色背景分別表示粳、秈稻低溫應答模式差異核心基因和代謝物