南京農(nóng)業(yè)大學(xué)張紹鈴團隊研究成果入選2020年中國農(nóng)業(yè)科學(xué)重大進展

　　11月20日，由農(nóng)業(yè)農(nóng)村部科技教育司指導(dǎo)、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院、中國農(nóng)學(xué)會、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部科技發(fā)展中心聯(lián)合主辦的2020年中國農(nóng)業(yè)農(nóng)村科技發(fā)展高峰論壇在南京舉行。論壇上發(fā)布了《2020中國農(nóng)業(yè)科學(xué)重大進展》，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)張紹鈴教授團隊研究成果“高雜合物種單倍型基因組組裝的新方法”成功入選。

 

　　植物基因組組裝大多采用二倍體或者多倍體材料進行混合測序并組裝，對于一些雜合度低和重復(fù)序列比例少的物種而言，單倍型基因組組裝的難度并不是很凸顯，但是對于一些自交親和及高雜合的物種，單倍型染色體之間的差異會導(dǎo)致最終基因組存在大量嵌合組裝，而利用這種嵌合基因組將不利于這些物種的后續(xù)重測序、進化、基因功能等方面的研究。

 

　　張紹鈴教授團隊在成功組裝了世界首個梨基因組精細圖譜及變異圖譜的基礎(chǔ)上，利用12個花粉單細胞對所構(gòu)建的3.8萬條人工染色體（BAC，bacterial artificial chromosome）進行單倍型分型，創(chuàng)建了基于“條形-編碼”（Bar-coding）的單倍型基因組組裝方法，成功組裝了梨兩套單倍型基因組。通過這種方法鑒定出了原參考基因組中8.12%的由于雜合引起的嵌合組裝基因，并對所測的‘碭山酥梨’基因組兩個單倍型之間的差異進行了系統(tǒng)分析。同時，這種方法不僅可以利用花粉單細胞測序?qū)AC進行分型，也可以結(jié)合多種長讀長測序技術(shù)（如Pacbio）用于解決復(fù)雜植物基因組的單倍型基因組組裝難題，有助于推動農(nóng)作物及經(jīng)濟作物等植物基因組的研究。

 

　　該研究成果于2019年10月在基因組研究權(quán)威期刊《Genome Research》上發(fā)表，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)為第一完成單位，張紹鈴教授為通訊作者，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)博士生施冬青為論文第一作者，吳俊教授、殷豪副教授以及福建農(nóng)林大學(xué)唐海寶教授為共同第一作者，吳巨友教授、陶書田教授、齊開杰老師、謝智華老師參與了該研究工作，并得到了國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金重點項目的資助。

 

　　中國農(nóng)業(yè)科學(xué)重大進展每年評選一次，遴選時以我國各類科研機構(gòu)正式發(fā)表的農(nóng)業(yè)領(lǐng)域高水平科學(xué)研究論文為基礎(chǔ)，根據(jù)“前沿引領(lǐng)、開創(chuàng)卓越、重大突破”的原則，經(jīng)過初選、專家評審及推薦、綜合遴選、解讀發(fā)布等過程，最終選出10項能夠充分代表當年我國農(nóng)業(yè)科技前沿研究水平的基礎(chǔ)科學(xué)研究成果。