青島農業(yè)大學生命科學學院省高校植物生物技術重點實驗室副教授朱丹與美國、加拿大等百余家科研機構的研究者共同參與的1KP項目“千種動植物基因組測序計劃”科研成果以封面論文的形式在10月底《Nature》發(fā)表，朱丹老師長期以來一直致力于植物耐逆境的生理與分子生物學研究，已在該研究領域發(fā)表SCI論文30余篇。其以青島農大為申請單位主持的國家自然科學基金項目所用的極度耐鹽堿野大豆品種也參與了該Nature發(fā)表的1KP測序計劃，提升了我校國際影響力。
上述研究工作得到國家自然科學基金和青島農業(yè)大學高層次人才等項目的資助。
文章鏈接：One thousand plant transcriptomes and the phylogenomics of green plants.（https://www.nature.com/articles/s41586-019-1693-2）
圖注：綠色植物的多樣性
該論文對1124種植物物種的營養(yǎng)器官進行了轉錄組測序和深入分析，對綠色植物的進化進行了全面的系統(tǒng)基因組探討。該數(shù)據(jù)研究發(fā)現(xiàn)基因家族的大規(guī)模擴展早在綠色植物、陸生植物和維管植物出現(xiàn)之前就已經(jīng)存在，推測蕨類植物在向開花植物進化過程中全基因組復制反復出現(xiàn)。
圖注：評價植物界最大基因家族最顯著的擴張和減縮
基因家族的顯著擴張和減縮是導致植物代謝、調控和信號轉導進化的主要因素之一。該論文對植物里最大的23個功能基因家族在不同物種中的進化進行了分析，推斷AP2, bHLH, bZip和WRKY 轉錄因子家族應該是在綠色植物界最后的共同祖先中開始出現(xiàn)；而GRAS和NAC基因家族的起源則發(fā)生在與綠藻譜系分化后的早期鏈霉菌中。最顯著的基因家族擴張和減縮事件是發(fā)生在綠色植物界出現(xiàn)和維管植物進化形成的過程中，但是在被子植物出現(xiàn)的過程中并沒有發(fā)現(xiàn)有基因家族的擴張。該論文的研究為增進我們對綠色植物的總體系統(tǒng)發(fā)育和在進化過程中發(fā)生的重大遺傳變化的理解奠定了基礎。
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