9月17日,Molecular Biology and Evolution(IF5-y=13.401)在線發(fā)表江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹所草莓研究室趙密珍團(tuán)隊與中國科學(xué)院華南植物園的合作研究成果,揭示森林草莓和飯沼草莓是八倍體栽培草莓的二倍體祖先,而綠色草莓、黃毛草莓和西藏草莓并非其二倍體祖先。這一結(jié)果破解了半個多世紀(jì)以來栽培草莓的起源之爭,結(jié)束了近一年半Nature Genetics(IF5-y=30.331)三篇論文的“口水戰(zhàn)”。
從上世紀(jì)起,栽培草莓的起源一直為科學(xué)家所困擾。2011年美國佛羅里達(dá)大學(xué)研究團(tuán)隊首次確定森林草莓是八倍體栽培草莓的一個二倍體祖先,揭開了八倍體栽培草莓起源的神秘面紗,之后日本、英國、美國、中國多家團(tuán)隊展開科研競賽。2019年2月美國加州大學(xué)及合作者在Nature Genetics上發(fā)表論文,推測八倍體栽培草莓有4個不同的二倍體祖先:森林草莓、飯沼草莓、綠色草莓和日本草莓;2020年1月俄勒岡州立大學(xué)及合作者基于同套數(shù)據(jù)在Nature Genetics上認(rèn)為,僅可確定八倍體草莓的兩個二倍體祖先:森林草莓和飯沼草莓;同期美國加州大學(xué)及合作者在Nature Genetics上給予反擊,堅持己見。一時間,硝煙四起,讀者迷茫。
果樹所與華南植物園從2017年起合作開展綠色草莓、黃毛草莓和西藏草莓染色體級別的全基因序列組裝,結(jié)合已發(fā)表的高質(zhì)量森林草莓、飯沼草莓基因組,利用比較基因組和sppIDer(新的基于測序數(shù)據(jù)的物種鑒定工具)方法,解釋了不同團(tuán)隊基于同一套數(shù)據(jù),采用不同參數(shù)或方法得出截然不同結(jié)論的原因,證實了八倍體栽培草莓的真正起源。
果樹所王靜研究員與華南植物園馮超博士為論文共同第一作者,趙密珍和華南植物園康明研究員為論文共同通訊作者。