土壤鹽堿化降低了土壤肥力和農(nóng)作物產(chǎn)量,對全球農(nóng)業(yè)構(gòu)成威脅。隨著化肥使用不當(dāng)、過度灌溉和工業(yè)污染等問題加劇,鹽漬化土壤的面積仍在擴(kuò)大。因此,提高作物的抗鹽堿能力是未來作物育種的主要方向之一,而植物響應(yīng)鹽脅迫的分子機(jī)制研究將為培育耐鹽作物提供重要線索。
近日,中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所陳宇航組解析了鹽脅迫響應(yīng)信號通路SOS(Salt Overly Sensitive)信號通路中關(guān)鍵Na+/H+轉(zhuǎn)運蛋白SOS1的三維結(jié)構(gòu),揭示了SOS1激活的分子機(jī)制。該研究組利用冷凍電鏡技術(shù)解析了水稻SOS1全長蛋白處于自抑制狀態(tài)(OsSOS1FL)和截短體處于超激活態(tài)(OsSOS1976)的三維結(jié)構(gòu)。OsSOS1FL結(jié)構(gòu)揭示SOS1是一個同源二聚體,每個單體亞基都有一個NhaA-fold的跨膜結(jié)構(gòu)域(TMD)和三個位于胞內(nèi)的調(diào)控結(jié)構(gòu)域,分別是螺旋結(jié)構(gòu)域(HD)、環(huán)核苷酸結(jié)合結(jié)構(gòu)域(CNBD)和C端b-roll結(jié)構(gòu)域(CTD)。兩個高度保守的motif(motif-1和motif-2)結(jié)合在胞內(nèi)調(diào)控結(jié)構(gòu)域上,形成自抑制的構(gòu)象狀態(tài)。OsSOS1976結(jié)構(gòu)揭示其支架結(jié)構(gòu)域和轉(zhuǎn)運結(jié)構(gòu)域發(fā)生類似電梯運輸?shù)?ldquo;上/下”運動,并伴隨著跨膜螺旋TM5b向下移動和門控殘基Pro148位置遷移。
該研究基于深入的結(jié)構(gòu)分析,提出了SOS1的工作模式。在沒有鹽脅迫的情況下,激活前SOS1的胞內(nèi)調(diào)控結(jié)構(gòu)域通過結(jié)合保守的自抑制motif而得以穩(wěn)定,其HD結(jié)構(gòu)域的H8/H9螺旋對與TM5b互作,使得門控殘基Pro148處于阻斷Na+結(jié)合的位置,從而維持一種無轉(zhuǎn)運活性的自抑制狀態(tài)。當(dāng)植物遭遇鹽脅迫時,胞內(nèi)升高的鈣信號被SOS3所感知并與SOS2形成復(fù)合物來激活其蛋白激酶活性,進(jìn)一步磷酸化Na+/H+轉(zhuǎn)運蛋白SOS1。SOS1磷酸化后使得其自抑制解除,胞內(nèi)調(diào)控結(jié)構(gòu)域發(fā)生劇烈的構(gòu)象變化,尤其是解除HD結(jié)構(gòu)域的H8/H9螺旋對與TM5b的緊密接觸,引起TM5b的下移和motif 144SATDP148解開延伸,伴隨發(fā)生Pro148位置遷移(從阻斷Na+結(jié)合到允許Na+ 轉(zhuǎn)運)。上述研究解釋了SOS1如何從靜息的自抑制狀態(tài)切換到激活狀態(tài),為探討SOS1激活的分子機(jī)制奠定了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。
10月26日,相關(guān)研究成果以Structure and activation mechanism of the rice Salt Overly Sensitive 1(SOS1) Na+/H+ antiporter為題,在線發(fā)表在《自然-植物》(Nature Plants,DOI:10.1038/s41477-023-01551-5)上。生物物理研究所、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)等的科研人員參與研究。同時,陳宇航等在《自然-植物》上配發(fā)了研究簡報(Structural insight into SOS signalling in response to salt stress,DOI:10.1038/s41477-023-01553-3)。研究工作得到中國科學(xué)院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(A類)和國家重點研發(fā)計劃的支持。