近日,西北農林科技大學園藝學院旱區(qū)作物逆境生物學國家重點實驗室管清美/徐記迪課題組在Plant Biotechnology Journal上發(fā)表了題為“Histone deacetylase MdHDA6 is an antagonist in regulation of transcription factor MdTCP15 to promote cold tolerance in apple”的研究論文,揭示了組蛋白去乙?;窶dHDA6在調控MdTCP15誘導的轉錄激活或抑制中起拮抗作用,以正向調控蘋果耐寒性,揭示了MdHDA6-MdTCP15模塊調控蘋果響應低溫脅迫的分子機制。
低溫對蘋果樹生長易造成嚴重威脅,特別在開花期間影響其坐果率,果實生產力造成巨大損失。因此,揭示蘋果植物響應低溫脅迫的分子機制使我們能夠利用調節(jié)機制進行作物改良。
為探究 MdHDA6 在蘋果低溫脅迫下的調控作用,本研究獲得了MdHDA6過表達( MdHDA6 -OE)和RNA干擾( MdHDA6 -RNAi)蘋果轉基因系,并進行低溫處理。結果顯示 MdHDA6 -OE植株表現(xiàn)出更強的抗寒性,而沉默株系則更敏感。眾所周知,組蛋白去乙?;梢允站o染色質結構并最終抑制基因表達。因此作者選擇了四個低溫負調控因子( PRR5 , NAC029 , ABI1 和 PIF3 ),并通過ChIP-qPCR以驗證其H3ac水平,發(fā)現(xiàn)MdHDA6促進低溫相關基因的組蛋白去乙?;⒁种破浔磉_,正向調控蘋果的抗寒性。
MdHDA6是一種催化酶,不具有結合下游基因的能力。有研究報道HDAs可以直接與轉錄因子(TFs)相互作用,并依靠轉錄因子的結合能力靶向下游基因。隨后,研究發(fā)現(xiàn)MdHDA6與轉錄因子MdTCP15相互作用,并促進MdTCP15上的組蛋白去乙酰化并抑制其表達。因此,探索MdTCP15在蘋果對冷脅迫反應中的調節(jié)作用,過表達 MdTCP15 降低了蘋果的耐寒性。相比之下, MdTCP15 -RNAi株系在低溫處理下與GL-3植物相比顯示出更強的耐寒性。進一步研究發(fā)現(xiàn),MdTCP15可以激活低溫負調控因子表達,并抑制低溫正調控因子,從而負向調節(jié)蘋果的耐寒性。由于MdTCP15是一種轉錄因子,因此可以直接與下游靶基因結合,對其靶基因進行轉錄調控。通過ChIP-qPCR和EMSA驗證發(fā)現(xiàn)MdTCP15與MdABI1和MdCOR47啟動子結合,Dual-luc實驗進一步說明MdTCP15可以激活MdABI1的表達,抑制MdCOR47的表達,然而共同表達MdHDA6和MdTCP15后發(fā)現(xiàn),MdHDA6通過直接與MdTCP15相互作用來抑制MdTCP15對靶基因的轉錄調控。
綜上,MdHDA6-MdTCP15模塊對蘋果低溫相關基因的新調節(jié)機制:(1)MdTCP15 依靠其DNA結合能力,MdTCP15招募MdHDA6至靶基因 MdABI1,使MdHDA6對MdABI1基因組區(qū)域進行組蛋白去乙酰化,抑制其表達,增強耐寒性;(2)MdHDA6的參與抑制了MdTCP15對冷低溫負調控因子 MdABI1 的激活,從而增強了耐寒性;(3)MdHDA6的參與抑制了MdTCP15對MdCOR4表達的抑制,這對蘋果耐寒性有積極調控作用。
徐記迪副教授為論文的通訊作者,碩士生郭美苗為論文第一作者,該項目得到了國家自然科學基金、陜西省重大科技專項、陜西省人才引進專項的資助。
原文鏈接:https://doi.org/10.1111/pbi.14128