研究提出線粒體基因組組裝新策略

　　近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所提出線粒體基因組組裝新策略，發(fā)表了7個高質(zhì)量的高粱細胞器基因組，揭示了高粱線粒體基因組構(gòu)象之間的差異與高粱馴化歷史的關(guān)系。相關(guān)研究成果發(fā)表在《BMC植物生物學(xué)（BMC Plant Biology）》上。

 

　　由于復(fù)雜的結(jié)構(gòu)變化和長段的重復(fù)性DNA，高粱的細胞器基因組組裝十分困難，為解決這一問題，科研人員利用線粒體基因組構(gòu)象提出了新型組裝策略，該方法將七種不同的高粱基因組分為三種類型，通過比較基因組學(xué)方法，發(fā)現(xiàn)栽培高粱在東非和西非的兩次獨立馴化事件均與線粒體基因組結(jié)構(gòu)類型相關(guān)聯(lián)?？蒲腥藛T進一步研究發(fā)現(xiàn)，這些轉(zhuǎn)移序列在不同材料的染色體區(qū)域間的富集模式不同，這為了解細胞器轉(zhuǎn)移序列在細胞核內(nèi)的進化以及栽培高粱馴化歷史提供了理論依據(jù)和新思路。

 

　　該研究得到深圳市優(yōu)秀科技創(chuàng)新人才培養(yǎng)-優(yōu)秀青年基礎(chǔ)研究，國家自然科學(xué)基金，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院“青年英才計劃”等項目支持。

 

　　原文鏈接：https://doi.org/10.1186/s12870-023-04104-2