生育期 (特別是開花期)是影響大豆品種分布和產(chǎn)量的重要因素之一,大豆生育期調(diào)控基因的挖掘和研究,對(duì)選育生態(tài)適應(yīng)性廣的優(yōu)良大豆品種至關(guān)重要。迄今,諸多調(diào)控大豆生育期的E系列基因已被克隆,它們的應(yīng)用提高了育種效率和產(chǎn)量,但是由于光周期調(diào)控大豆開花的復(fù)雜性,還有很多生育期重要基因未被發(fā)掘,具體調(diào)控機(jī)制仍不明確。
東北地理所大豆分子設(shè)計(jì)育種學(xué)科組長(zhǎng)期致力于新的開花期基因發(fā)掘,助理研究員王飛飛利用Minsoy (E1e2e3E4)和Archer (e1ase2E3E4)雜交后構(gòu)建的MA重組自交系進(jìn)行長(zhǎng)日照條件下開花期QTL檢測(cè),通過(guò)親本重測(cè)序和MA群體SLAF-seq,結(jié)合MA群體的花期表型,檢測(cè)到一個(gè)重要調(diào)控位點(diǎn)TOF7 (Time of Flowering 7)。進(jìn)一步研究表明該位點(diǎn)由單基因控制,且編碼基因TOF7控制早花早熟,其候選基因?yàn)橐粋€(gè)擬南芥光周期調(diào)控開花途徑中關(guān)鍵生物鐘基因的同源基因。TOF7是一個(gè)新的控制大豆開花的位點(diǎn),被世界大豆委員會(huì)命名為 E11,其E11/e11 的基因特征被大豆委員會(huì)所認(rèn)可。
李趙博博士利用全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-wide association studies, GWAS)技術(shù)與擬南芥重要生物鐘基因進(jìn)行同源比對(duì)的方法,在大豆中鑒定到一調(diào)控開花期新基因LNK2 (Night light-inducible and clock-regulated 2)。利用CRISPR/Cas9開發(fā)出LNK2基因的轉(zhuǎn)基因四重純合突變體,在長(zhǎng)日照條件下,四重突變體的開花時(shí)間明顯早于野生型。熒光定量PCR顯示,在長(zhǎng)日照條件下,LNK2的轉(zhuǎn)錄水平明顯低于野生型。LNK2促進(jìn)了豆類特異性E1基因的表達(dá),并抑制了開花素FT2a的表達(dá)。這些結(jié)果表明,CRISPR/CAs9介導(dǎo)的4個(gè)LNK2基因的靶向突變縮短了大豆的開花時(shí)間。
該研究的發(fā)現(xiàn)增加了控制大豆開花時(shí)間的新成員,將進(jìn)一步完善大豆開花調(diào)控網(wǎng)絡(luò),為大豆分子設(shè)計(jì)育種提供基因資源和理論依據(jù)。本研究獲得國(guó)家自然科學(xué)面上項(xiàng)目(No. 31972966)和國(guó)家重點(diǎn)研究開發(fā)項(xiàng)目(2017Y FD0101305)的資助。
Zhaobo Li, Qun Cheng, Zhuoran Gan et al., Multiplex CRISPR/Cas9-mediated knockout of soybean LNK2 advances flowering time. The Crop Journal, 2020, https://doi.org/10.1016/j.cj.2020.09.005
Feifei Wang, Haiyang Nan, Liyu Chenet al., A new dominant locus, E11, controls early flowering time. Molecular breeding, 2019, 39:70