山葡萄是一種在東亞地區(qū)廣泛分布的野生葡萄,能在-30℃以下的極端低溫下安全越冬,具有極高的耐寒性,是葡萄抗寒育種的理想材料。受到高雜合度等因素的影響,目前對與山葡萄基因組的研究尚不深入,對其高寒冷耐受性的機(jī)制的研究也處于起步階段。
中國科學(xué)院植物研究所葡萄與葡萄酒研發(fā)團(tuán)隊(duì)聯(lián)合中科院武漢植物園、福建農(nóng)林大學(xué)及中國環(huán)境科學(xué)研究院等,繪制了山葡萄的高質(zhì)量全基因組精細(xì)圖譜,為葡萄耐寒機(jī)制研究奠定了基礎(chǔ)。研究發(fā)現(xiàn),葡萄對于冷害和凍害的應(yīng)答或存在不同的調(diào)控機(jī)制,MYB14和CBF3等基因在冷害的早期應(yīng)答中具有重要作用,而糖類代謝可能是影響葡萄凍害的重要因素之一。該研究還利用GWAS和轉(zhuǎn)錄組分析手段證明糖酵解通路中的關(guān)鍵基因PGK對葡萄在嚴(yán)寒條件下越冬具有重要意義。
根據(jù)獲得的山葡萄基因組,團(tuán)隊(duì)克隆到控制山葡萄耐冷的GRAS轉(zhuǎn)錄因子PAT1,并揭示了PAT1調(diào)控山葡萄耐冷性的遺傳調(diào)控機(jī)制。研究發(fā)現(xiàn),PAT1通過與INDETERMINATE-DOMAIN 3蛋白互作來激活LIPOXYGENASE 3基因的表達(dá),以促進(jìn)茉莉酸的生物合成,從而提高葡萄耐冷性。
近日,相關(guān)研究成果分別在線發(fā)表在The Plant Journal和Plant Physiology上。植物所特別研究助理王毅、已畢業(yè)博士生王澤民分別為兩篇論文的第一作者,植物所研究員梁振昌為論文通訊作者。研究工作得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、生態(tài)環(huán)境部生物多樣性調(diào)查與評價(jià)項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、寧夏回族自治區(qū)育種專項(xiàng)、中科院國際合作項(xiàng)目的資助。