7月6日,西北農(nóng)林科技大學(xué)園藝學(xué)院陳書霞教授團(tuán)隊在《Horticulture Research》上在線發(fā)表題為 “QTL mapping of fruit aroma compounds in cucumber (Cucumber sativus L.) based on the recombinant inbred line (RIL) population” 的研究論文,在黃瓜果實香氣QTL定位研究及候選基因預(yù)測方面取得新進(jìn)展,研究結(jié)果將為黃瓜果實風(fēng)味改良提供指導(dǎo)。
獨特的清香味是黃瓜果實的重要特色,是風(fēng)味品質(zhì)的重要組成部分,也是吸引消費者和增強(qiáng)市場競爭力的重要因素。一直以來,黃瓜清香味的形成和調(diào)控機(jī)理一直受到研究者的關(guān)注,但如何改良和調(diào)控果實形成適宜的風(fēng)味,以適應(yīng)國內(nèi)外市場對果實品質(zhì)不斷提高的消費需求,是研究者一直關(guān)注的重要研究方向。青草味的C6醛類香氣和花香味的C9醛類香氣是構(gòu)成黃瓜果實香氣揮發(fā)物的主體成分。然而目前對黃瓜果實醛類香氣物質(zhì)含量的數(shù)量性狀位點(QTL)及候選基因的研究進(jìn)展較少。該研究基于Q16×Q24重組自交系群體的重測序數(shù)據(jù)構(gòu)建了高密度遺傳圖譜。基于該圖譜共檢測到關(guān)于黃瓜主要醛類香氣物質(zhì)在2019年秋(2019a)和2020年春(2020s)兩個季節(jié)的28個QTLs。它們分布在6條染色體上,這些QTLs解釋了香氣物質(zhì)2.11%到39.30%的表型變異。
在C9醛類香氣中,掃描到一個與C9醇類特征香氣(E, Z)-2, 6-nonadien-1-ol相關(guān)的主效QTL,命名為qol8-2.1,分別解釋該香氣物質(zhì)的11.76%(2019a)和17.53%(2020s)。qol8-2.1位于染色體2上mk190和mk204標(biāo)記之間,物理位置在19.80 cM~25.53 cM之間。通過基因組掃描發(fā)現(xiàn),該區(qū)間有9個脂氧合酶基因,其中CsLOX08基因表達(dá)水平與(E, Z)-2, 6-nonadien-1-ol含量呈顯著正相關(guān),且雙親中的CsLOX08蛋白在雙親間具有5個氨基酸的變異。此外,與Q16相比,在Q24 DNA基因組的第五個內(nèi)含子發(fā)現(xiàn)了8 bp的插入變異。因此,初步把CsLOX08推測為qol8-2.1的候選基因。
基于CsLOX08基因在親本中的插入變異,本研究開發(fā)了一個功能性InDel分子標(biāo)記?;谠揑nDel標(biāo)記對RIL群體中進(jìn)行基因分型,結(jié)果表明,CsLOX08可能是qol8-2.1位點的候選基因,且開發(fā)的功能性InDel分子標(biāo)記可作為C9醛類香氣(E, Z)-2, 6-nonadien-1-ol含量的分子輔助育種篩選標(biāo)記。該研究為黃瓜果實香氣的合成及調(diào)控機(jī)制奠定了理論基礎(chǔ)。
陳書霞教授為該論文通訊作者,博士研究生孫銀輝和李許真為該論文的共同第一作者。該研究獲得國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金的資助。
原文鏈接:https://doi.org/10.1093/hr/uhac151